空间转录组技术在一定程度上提供了基因表达空间异质性信息，但如何在大组织区域内进行高分辨率、多组学、无偏差的生物信息分析仍然是一个科学难题。耶鲁大学樊荣教授团队提出了一种全新的空间高分辨率多组学研究方法——基于微流体条码标记的空间多组学测序(DBiT-seq)。利用DBiT-seq技术，本文分析了小鼠胚胎中早期器官发育的主要组织类型，并展示了小鼠胚胎发育中全转录组和22个蛋白质的空间高分辨率共作图。基因表达和蛋白积累数据进一步确定了胚胎前脑发育和微血管网络的差异调控模式。文章还以10μm像素的高分辨率检测到了排列在视囊泡周围的单层黑色素细胞。
樊荣教授实验室开发了一种全新的高分辨率(~10μm)空间多组学测序技术DBiT-seq，可同时对转录组、蛋白质或其他组学进行研究，利用这项技术对整个小鼠胚胎进行了空间多组学图谱(蛋白质和mRNA)绘制，并获得了许多新的知识。通过DBiT-seq技术检测的转录组信息，可以在小鼠胚胎早期器官发生阶段确定主要的组织类型，重建的空间蛋白表达谱能够很好地解析小鼠胚胎脑组织病理图像中难以分辨的微血管网络，清晰地显示视囊泡周围的黑色素细胞单层。
DBiT-seq是一种全新的空间高分辨率多组学研究技术，由于这项技术不受组织新鲜度的限制，有潜力成为绘制一系列分子信息(蛋白质、转录组和表观基因组)的通用方法。其潜在影响将是广泛和深远的，有望应用于许多不同领域的基础和转化研究，包括胚胎学，神经科学，癌症和临床病理学等。
参考：新格元
High-Spatial-resolution Multi-Omics Sequencing via Deterministic Barcoding in Tissue
