三年公元（658年）
1、
春，正月五日，长孙无忌等上呈所修订的新礼仪（显庆礼）；皇帝下诏，全国推行。之前，议论的人认为贞观礼不够完备，所以皇帝命长孙无忌等修订。当时许敬宗、李义府用事，所增删之处，多迎合皇帝的意思，学者们有非议。太常博士萧楚材等认为事先准备君王崩逝之后的礼仪，不是臣子所该说的；许敬宗、李义府深以为然，于是焚毁《国恤》一篇，由此，葬礼仪式就缺失了。
华杉曰：
马屁精的“政治正确”和看问题的角度，是常人无法想象的，本来是为了完备礼仪，一句“豫备凶事，非臣子所宜言”，竟然把葬礼一章全部取消了！那皇帝死后，就不准备葬礼了吗？还是皇帝自己把握？
2、
当初，龟兹王布失毕的妻子阿史那氏和他的宰相那利私通，布失毕不能禁止，由此君臣猜疑，各有党羽，各自派使者来朝廷告状。皇上把他们两人都召来京师，到了之后，囚禁那利，派左领军郎将雷文成送布失毕归国。到了龟兹东境泥师城，龟兹大将羯猎颠发兵阻挡，并遣使向西突厥沙钵罗可汗投降。布失毕据城自守，不敢前进。皇帝下诏，命左屯卫大将军杨胄发兵讨伐。正巧布失毕病逝，杨胄与羯猎颠交战，大破之，生擒羯猎颠及其党羽，全部诛杀，于是以其地设置为龟兹都督府。
正月二十五日，立布失毕之子素稽为龟兹王兼都督。
3、
二月四日，皇上从东都出发；二月二十一日，回到京师。
4、
夏，五月二日，将安西都护府迁到龟兹，重新以旧安西为西州都督府，镇守高昌故地。
5、
六月，营州都督兼东夷都护程名振、右领军中郎将薛仁贵率军攻打高丽赤烽镇，攻拔，斩首四百余级，俘虏一百余人。高丽派大将豆方娄率军三万拒战，程名振以契丹兵逆击，大破之，斩首二千五百级。
6、
秋，八月四日，播罗哀（广西信宜一带）獠人酋长多胡桑等率众归附。
7、
冬，十月十一日，吐蕃赞普派来来请婚。
8、
中书令李义府受皇上宠爱，他的儿子们还在怀抱之中，就已经名列高官显贵。而李义府贪得无厌，母亲、妻子及儿子、女婿们，卖官鬻狱，门庭若市，又多树朋党，倾动朝野。中书令杜正伦常以前辈自居，而李义府仗恃皇帝恩宠，不愿意居于他之下，由此二人有了矛盾，与李义府在皇上跟前争讼。皇上以大臣不和，两个都斥责。十一月六日，贬杜正伦为横州（广西横州）刺史，李义府为普州（四川安岳县）刺史。杜正伦不久在横州去世。
9、
阿史那贺鲁既被擒，对萧嗣业说：“我本是一个亡命之徒，先帝救我一命（事见公元648年记载），先帝厚待我，而我辜负他，今日之败，是上天对我发怒。我听说中国对人处死刑必定要在闹市，希望能把我在昭陵之前处刑，以谢先帝。”皇上听闻，怜悯他。贺鲁到了京师，十一月十五日，押到昭陵前献俘。敕免其死，分其部落为六个都督府，他所役属的诸国都设置州府，向西一直到波斯，都隶属于安西都护府。贺鲁不久去世，葬于颉利墓侧。
10、
十一月十九日，任命许敬宗为中书令，大理卿辛茂将为兼侍中。
11、
开府仪同三司、鄂忠武公尉迟敬德薨逝。尉迟敬德晚年闲居，学习延年益寿之术，修饰亭台楼阁，花园池塘，每日以歌舞音乐自娱，不交通宾客，历时十六年，七十四岁病逝，朝廷恩礼甚厚。
12、
本年，爱州刺史褚遂良去世。
13、
雍州司士许祎与来济（去年贬为台州刺史）关系亲厚，侍御史张伦与李义府有怨仇，吏部尚书唐临奏请任命许祎为江南道巡察使（巡察范围包括台州），张伦为剑南道巡察使（巡察范围包括普州）。当时李义府虽在外，皇后常保护他。认为唐临为挟带私仇，恶意选授官员。
四年（公元659年）
1、
春，二月十八日，将唐临免官。
2、
三月五日，西突厥兴昔亡可汗与真珠叶护战于双河，斩真珠叶护。
3、
夏，四月十日，任命于志宁为太子太师、同中书门下三品；四月十九日，任命黄门侍郎许圉（yu）师参知政事。
4、
武后认为太尉赵公长孙无忌受重赐而不帮助自己，深为怨恨。后来讨论废王皇后，燕公于志宁中立不言，武后也不悦。许敬宗屡次向长孙无忌说以利害，长孙无忌都当面折辱他，许敬宗也怨恨。武后既立，长孙无忌内心不能自安，皇后令许敬宗找机会构陷他。
正巧洛阳人李奉节告太子洗马韦季方、监察御史李巢结为朋党，皇帝敕令许敬宗与辛茂将调查。许敬宗刑讯逼供，韦季方不堪忍受，自杀未遂，许敬宗于是诬奏韦季方想要与长孙无忌构陷忠臣近戚，让大权归长孙无忌，伺机谋反，如今事情被察觉，所以自杀。皇上惊道：“岂有此事！舅舅是被小人所间，心里稍微不悦倒是可能，何至于反！”许敬宗说：“臣反复推敲事件始末，反状已露，陛下犹以为疑，恐怕不是社稷之福。”皇上哭泣说：“我家不幸，亲戚间屡有异志，往年高阳公主与房遗爱谋反，如今舅舅又这样，让朕惭愧于见天下之人。这件事如果是实，该怎么办？”回答说：“房遗爱一个乳臭小儿，与一女子谋反，能成什么事！长孙无忌与先帝谋取天下，天下都佩服他的智慧；为宰相三十年，天下都畏惧他的威严；如果一朝发动，陛下派谁去抵挡？如今赖宗庙之灵，皇天疾恶如仇，因调查一件小事，查出大奸，实在是天下之庆。臣担心长孙无忌知道韦季方自杀，窘急发谋，振臂一呼，同恶云集，必为宗庙之忧。臣之前见宇文化及父亲宇文述为隋炀帝所亲任，结为婚姻，委以朝政；宇文述死后，宇文化及又典掌禁兵，一夜之间，于江都作乱，先杀不依附自己的人，臣家也遭其祸（许敬宗的父亲许善心，事见公元618年记载），于是大臣苏威、裴矩之徒，都舞蹈跪拜于马首，唯恐不及，到了黎明十分，就倾覆隋室。前事不远，愿陛下速决！”
皇上命许敬宗更加审察。第二天，许敬宗再次上奏说：“昨夜韦季方已承认与长孙无忌同反，臣又问韦季方：‘长孙无忌与皇帝至亲，累朝宠任，何恨而反？’韦季方回答说：‘韩瑗曾经对长孙无忌说：“柳奭、褚遂良劝您立梁王（李忠）为太子，如今梁王既废，皇上也怀疑您，所以将高履行（长孙无忌舅舅的儿子）贬出京师。”自此长孙无忌忧愁恐惧，渐渐开始为自保考虑。后来，看见长孙祥又被放逐，韩瑗也得罪，日夜与韦季方等谋反。’臣参验他的供词和事实，都相符合，请收捕法办。”皇上又哭泣说：“舅舅如果真这样，朕决不忍心杀他；如果杀了他，天下人会怎么看朕！后世将怎么说朕！”许敬宗回答说：“薄昭，是汉文帝的舅舅，汉文帝从代国到朝廷即位，薄昭也有功，他所犯的罪，不过是杀人而已，文帝派百官素服哭丧，杀了他，至今天下都以文帝为明主。今天长孙无忌忘两朝之大恩，密谋倾移社稷，其罪与薄昭不可同年而语。幸而奸状自发，逆徒招供，陛下还有什么疑虑，还不早下决断！古人有言：‘当断不断，反受其乱。’安危之机，间不容发。长孙无忌是当今奸雄，王莽、司马懿之流；陛下稍有拖延，臣恐变生肘腋，悔之无及！”皇上以为然，竟不召长孙无忌对质。四月二十二日，下诏削除无忌太尉及封邑，任命为扬州都督，于黔州安置，按一品官员生活待遇。长孙祥，是长孙无忌的堂侄，之前从工部尚书被贬为荆州长史，所以许敬宗以此来诬陷他。
许敬宗又上奏：“长孙无忌谋逆，由褚遂良、柳奭、韩瑗教唆煽动而成；柳奭仍勾结宫掖（王皇后），密谋下毒，于志宁也党附长孙无忌。”于是皇帝下诏，追削褚遂良官爵，将柳奭、韩瑗除名，免志宁官。遣使征发沿途军队，押送长孙无忌到黔州。长孙无忌的儿子、秘书监、驸马都尉长孙冲等都除名，流放岭南。褚遂良的儿子褚彦甫、褚彦冲流放爱州，在路上杀死。益州长史高履行再贬为洪州都督。
华杉曰：
长孙无忌的冤案，许敬宗不费吹灰之力，信手拈来，随便编个故事就把他扳倒了。皇帝李治只听许敬宗一个人的汇报，连召长孙无忌来质问一次都没有，就下诏把他放逐。长孙无忌呢，连个解释申辩的机会都没有，突然就遭遇灭顶之灾。
我们要问，这是什么逻辑？背后的真因是什么？如果说，行有不得，反求诸己，长孙无忌做错了什么？他能不能避免这种情况？
背后的逻辑和真因，就是感情！宫廷政治就一个字——宠。宠爱，是一种感情，宫廷政治，是一种感情政治，感情在，政治就在；感情不在，政治就不在了。长孙无忌与李治，家族历史恩情深厚，但是两人现在的感情早已破裂。皇帝相信长孙无忌谋反，是他希望这是真的，这样他可以没有心理负担的摆脱他。皇帝不召长孙无忌来对质，正是害怕查出来他根本没有谋反。所以他自欺欺人的哭了两场，假仁假义的说即便他谋反我也不杀他，就把长孙无忌驱逐了。
长孙无忌犯的错误，是倚老卖老，欺负小孩子，这是历史上顾命大臣很容易犯的错误，越是德高望重的功勋老臣，越容易犯这个错误，把新君当晚辈小孩，要教他怎么做皇帝，而且还要手把手的教，他娶谁做媳妇也要以长辈身份管，他受得了吗？更何况这些管束，并非都是为他好，而是夹杂着自己的私心。近代的事，杨宇霆和常荫槐认为自己德高望重，张学良就把他们杀了。李治对长孙无忌的反抗，并不算激烈。
长孙无忌心目中，这皇帝小孩是他选的，他力挺上位的，当初李世民不是让李治向长孙无忌下拜，说“你舅舅已经许诺你了”吗？没有舅舅，就没有李治这个皇帝。但是，这些事，只能在李治做皇帝之前成立。他做了皇帝之后，他就是君，你就是臣，不能“君不君，臣不臣”，要向周公学习。长孙无忌再怎么位尊、德道、望重，在位、德、望三个方面，他都远远不能和周公相比，而周公在周成王这个小孩天子面前，始终都保持小心翼翼很恐惧的样子。因为本来那小孩天子就很可怕！你如果管束他，他的反抗可能就是杀你。
