酵素可有效瘦身减肥，这是理所当然的，食用综合酵素的同时也一并施行运动饮食控制，并持之以恒，效果更明显。
人体内的脂肪会囤积在肝脏、肾脏、动脉和毛细管中，吃下无酵素的食物（脂肪酶已遭破坏），不仅会导致肥胖，而且还会促使器官产生病变。
加热后的精致食物，会使人体脑垂体腺的大小及外观发生剧烈改变，这可由动物脑垂体腺切除后，引发血液中酵素数量的增加来证明。酵素会影响分泌荷尔蒙的腺体，而荷尔蒙也会影响酵素的数量。
由于熟食的过度刺激，会导致胰脏和脑垂体腺过度分泌，全身因此变得懒洋洋的，甲状腺功能不彰，于是变胖，生食较不会刺激腺体，体重的变化自然少。最明显的证明，就是当农民用生的马铃薯喂猪时，猪比较不容易养胖，是由于生马铃薯中的酵素发挥作用;不过，若用熟食喂猪，猪就容易胖。因此利用酵素减肥，可以运用断食法来配合，每星期断食1-3次（通常一次就够），每次16~24小时，断食期间以酵素补充体力，并配合运动、喝水、减肥效果甚佳。
