Zhang, Y., Kang, M. S., & Lamkey, K. R. (2005). DIALLEL-SAS05: A comprehensive program for griffing’s and Gardner-Eberhart Analyses. Agronomy Journal, 97(4), 1097. http://doi.org/10.2134/agronj2004.0260
Diallel交配设计为育种者提供了有用的遗传信息，如一般组合能力（GCA）和特异性组合能力（SCA），以帮助他们设计合适的育种和选择策略。在这里，我们报告了最初发布于1997年的DIALLEL-SAS的改进版本。新程序，DIALLEL-SAS05，有一个清晰和用户友好的界面，旨在满足用户的各种diallel交叉设计实验的需求。 DIALLEL-SAS05比DIALLEL-SAS具有以下主要优点：（i）它不仅分析了所有四个Griffing的diallel方法（固定和随机模型），而且还计算Gardner-Eberhart的分析II和III; （ii）其提供来自4至12的亲本数的dialle1实验的所需结果，（iii）其可分析来自任何数目环境的dialle1数据，和（iv）对于随机效应模型，其提供GCA（{ σ2g）和SCA（sigma 2s）方差，其可以用于估计加性（σ2 A）和优势（σ2 D）方差，并且最终的狭义遗传性（h 2）。 DIALLEL-SAS05还提供了GCA x ENV，SCA x ENV，倒数x ENV，母体x ENV和非母体x ENV相互作用的信息（如果适用）。 DIALLEL-SAS05应该大大提高研究人员在分析和解释diallel-cross数据的效率。程序代码可从相应作者的CD上获得。
Diallel交配设计是植物和动物育种计划中获得定量或复杂遗传性状遗传信息（如GCA和SCA）的重要工具（Hayman，1954; Griffing，1956; Fry，2004）。 Griffing's（1956）diallel方法已广泛用于作物植物（Evans等人，1966; Stuthman等人，1971; Borges，1987; Pixley和Bjarnason，1993; Kang等人，1995,1999; Zhang等人。，1996）。 Grif指出的四种方法的重要特征的一个有用的总结在Zhang和Kang（1997;表1）中给出。
Gardner和Eberhart（1966）提出了从异质父母/种群（“品种”）产生的二等位基因交叉数据的替代分析。 Gardner-Eberhart分析（GEAN）I是资源密集型的，需要评估n个亲本，n（n≥1）/ 2个F1杂交和亲本和杂交的近交后代，但提供了加性和优势基因作用的信息，杂种优势和近亲繁殖抑制（Gardner和Eber-hart，1966; Murray等，2003）。 GEAN II在评估n种群（品种）及其n（n？1）/ 2 F1杂交中有用; （Gardner和Eberhart，1966; Hallauer和Miranda，1988; Murray等，2003）。杂种进一步分为平均，品种和特异性杂种优势，但在分析II中不能确定加性和主导参数，因为它们与标记为“品种”的变异来源混杂（Murray等，2003）。 GEAN III从包含以下变异源的分析中提供了品种和GCA效应的估计：亲本，亲本与F1杂交和F1杂交; GCA效应以类似于Griffing的方法4，模型1 Murray等，2003）。 GEAN II和GEANIII都提供了平均杂种优势和SCA的估计（Gardner和Eberhart，1966; Murray等，2003）。许多研究人员已经成功地利用GEAN研究杂种优势和估计品种diallels中的GCA和SCA（Crossa等人，1987; Ali等人，2001; Lee等人，2003）。
Murray et al。 （2003）指出，GEAN II和GEAN III的效应公式在生物学和遗传学上都是非生物学的，并且将父母数作为乘数。他们进一步认为，（i）在GEAN III中获得的品种效应是“无约束”估计，而来自GEAN II的品种效应是受限的估计，因为没有杂种优势;和（ii）结果对这些效应的使用和解释有影响。关于GEAN I，II和III的进一步具体细节，读者参考Murray et al。 （2003）。
自然由于繁琐的计算，研究人员认为需要开发用于分析拨号数据的计算机程序。已开发了用于作物育种的程序代码（Burrow和Coors，1994; Kang，1994; Magari和Kang，1994; Zhang和Kang，1997）和树木育种（Wu and Matheson，2000,2001; Xiang and Li，2001 ）。 Murray et al。 （2003）报告了一个用于GEAN II和GEAN III的SAS计算机程序;该程序使用具有细胞平均值的一般线性模型来估计各种遗传效应。 Zhang和Kang（1997）的DIALLEL-SAS程序已被广泛使用，例如，分析玉米中的二进制跨数据（Zea mays L.）（Kang等
1999，2005; Naidoo等，2002; Lee等人，2003），油菜籽（Brassica napus L.）（Goffman和Becker，2001），小麦（Triticum aestivum L.）（Le Gouis等人，2002; Hakizimana等人，2004），硬粒小麦Triticum turgidum L.var.duum）（Solomon和Labuschagne，2004），苜蓿（Medicago sativa L.）（Guines等人，2002; Riday和Brummer，2002a，2002b）和白羽扇豆（Lupinus albus L.） Lagunes-Espinoza等人，2003）。 DIALLEL-SAS的有用性可以得到增强。 DIALLEL-SAS（Zhang和Kang，1997）的限制是（i）虽然它可以容易地适应于两个环境的特定diallel集合（Griffing的方法1到4），用户必须修改代码以分析来自更多比两个环境，这可能很麻烦; （ii）它仅提供固定效应模型的结果; （iii）它需要对除了在张和康（1997）的示例程序中使用的n 5之外的父代号进行广泛和费力的程序修改;和（iv）它没有包括Gardner和Eberhart（1966）分析II和III。
目前，还没有已知的计算机程序处理Griffing的四个diallel方法和Gardner-Eberhart分析II和III的分析。因此，需要一种综合程序，不仅计算Griffing的diallel分析 - 固定和随机效应模型，而且还计算Gardner-Eberhart分析II和III。我们在这里报告称为DIALLEL-SAS05的这样一个程序的发展。
