如何优雅地做出高逼格的Western Blot?

Western Blot(WB),蛋白免疫印迹法,一句话,定性、定量检测蛋白表达的一种经典、有效的技术方法。

将电泳分离的细胞或组织蛋白转移到PVDF膜上,用特定抗体结合蛋白抗原,再结合标记的二抗,以化学发光的方式可视化地将蛋白表达情况呈现在人们面前,是几乎每一位生物汪或科研汪的“必怀利器”。Western Blot的Protocol那么多,然鹅,没有一款是适合你自己的。辛辛苦苦做了两天,还不包括前期的细胞培养、蛋白提取等等,显影结果一现,立马想哭晕在厕所,我的小心脏啊......

我也经历了不分昼夜的虐心历程,为了得到一条满意的条带,潜心做Western Blot一月余,有时在暗室(浸泡在老鼠味儿和饲料味儿中)一连曝光两个小时,出来后连午饭都不想吃了,终于,终于,终于,喜极而泣啊!

先上几幅我做的Western Blot结果:

引用一位师兄的话:“跑的Western跟砖一样”。现将个人做Western的心得体会分享给大家。

实验虐我千百遍,我待实验如初恋

言归正传,做好Western需要注意各种细节。工欲善其事,必先利其器,首先还是从蛋白提取开始谈起。

壹:蛋白提取

一、细胞蛋白的提取

1.收样前3min先配制细胞裂解液(现配现用),RIPA:蛋白酶抑制剂:磷酸酶抑制剂=99:1:1。6孔板收集蛋白每孔需200ul,计算用量。以收集六孔蛋白为例,按比例加入RIPA 1200ul,蛋白酶抑制剂12ul,磷酸酶抑制剂12ul,混匀后置于冰上。(我使用的试剂RIPA裂解液(中),蛋白酶抑制剂混合物(100×),蛋白磷酸酶抑制剂混合物(100×)均购自康为世纪公司)

2.弃掉旧的培养基,PBS洗三遍。

3.每孔加入200ul刚配好的裂解液,立即置于冰上,在摇床上裂解30min。

4. 30min后在冰上将6孔板中的细胞收集至EP管中(尽可能多地刮掉细胞)。

5. 14000g,15min(4℃)离心,取上清于EP管中即为提取的蛋白(最好用进口Axygen EP管,后文解释原因)。

注:2~4步也可先用胰酶收集细胞,离心,PBS洗三次,再向EP管中加入裂解液,置于冰上摇床裂解30min。我也尝试过这种方法,相比而言,上一种方法简便并节约时间,但可能会损失一些细胞,可根据实际情况选择。

二、组织蛋白的提取

(全程在冰上操作)

1.将动物组织(脑、肺等)取出后分装成三份或更多(一份WB,一份qPCR,一份备用),取出后立即存于-80℃。(注:取完一块组织后立即冻存于-80℃,反复冻存样品对待测蛋白有影响,最好用新鲜样品实验)

2.配制细胞裂解液(现配现用),组织:RIPA=1mg:10ul,可根据实际情况调整。RIPA:蛋白酶抑制剂:磷酸酶抑制剂=99:1:1。配好后置于冰上。

3.将其中一份组织剪下约90mg于有钢珠的震荡匀浆器中匀浆。此匀浆器的盖子或芯通常置于-20℃,使用时取出,操作应快捷,匀浆1min基本可保持温度。

4.将匀浆加入90ul现配的裂解液中,冰上摇床裂解30min。

5. 14000g,15min(4℃)离心,取上清于Axygen EP管中即为提取的蛋白。

贰:蛋白浓度测定

我采用的是康为世纪公司的BCA蛋白定量试剂盒测定提取蛋白浓度,和说明书protocol差别不大,稍有不同,如下:

1.稀释BSA标准品以制作标准曲线:取7支EP管,每管加30ul生理盐水,第一管加30ulBSA,混匀后再取30ul至第二管,依次倍比稀释,最后一管不加为空白(即本底值)。则8个标准品的浓度分别为2ug/ul、1ug/ul、0.5ug/ul、0.25ug/ul、0.125ug/ul、0.0625ug/ul、0.03125ug/ul、0。

2. 5倍稀释样品蛋白:取六支EP管(6个样品),各管加40ul NS,再分别取10ul样品在各管中稀释。

3.将8个标准品和稀释待测样品各加25ul于96孔板中。

4.配制BCA工作液:每个样品做2个重复,再加上8个标准品,一共20个孔,按22个孔算,以防加样损失。则需A液:200ul×22=4400ul,B液:4400ul/50=88ul,计算好所需体积后在一干净试管中将A、B工作液混匀。

6.混匀后立即向各孔中加入200ul配制的BCA工作液,37℃孵育30min。

7.酶标仪562nm下测定各样品和BSA标准品的吸光度值,作出标准曲线,计算出待测样品的浓度。

8.根据各样品浓度计算1×loading buffer体积,将各样品浓度调为一致;并计算5×loading buffer的体积,加入各管中。混匀后沸水煮15min,冰上分装,存于-20℃。

Tips

1.前面提到收集蛋白于进口Axygen EP管中,是为了防止煮沸蛋白时EP管盖子弹开,液体溅出而改变蛋白浓度。

2.关于分装体积,我提取的细胞蛋白调整浓度后约为1.5ug/ul,每次电泳上样20ul,所以分装体积每管50ul,一次或两次电泳即可用完,避免反复冻融。

叁:Western Blot

一、WB所需试剂

可提前配制:

1. 10×电泳缓冲液:

配制250ml 10×电泳液作为母液,依次称取Tris 7.5g,甘氨酸36g,SDS 2.5g,加双蒸水至250ml,常温保存。使用时用蒸馏水稀释至1×。

2. 1×电转液:

配制500ml 1×电泳液,依次称取Tris 2.9g,甘氨酸1.45g,SDS 0.185g,加双蒸水400ml,待都溶解后再加入100ml甲醇,常温保存。

配制的电泳液和电转液可供多次Western使用。

注意:1.最后加入甲醇,若先加甲醇,Tris、甘氨酸和SDS不易溶解。

2.溶解较慢时可用磁力搅拌器加快溶解。

现配现用:

分离胶、浓缩胶、5% BSA溶液(w/v)、5%牛奶(w/v)、1×TBST洗液、一抗和二抗,在WB步骤中详细介绍。

二、WB protocol

(一)清洗玻板和小烧杯:

戴好口罩和手套,选用1.0mm玻板,用试管刷和洗洁精仔细刷洗玻板,清水冲洗干净。卡槽对齐卡好后置于软橡胶垫片上,夹紧,向板中加满蒸馏水试板子是否漏液。观察几分钟后若不漏液,将板子中水倒出,倒扣晾干。

(二)配胶:

1.配制8ml 10%分离胶,依次向小烧杯中加入蒸馏水3.04ml,30%丙烯酰胺2.7ml,1.5M•pH8.8 2.0ml,10%SDS 80ul,10%AP 80ul,TEMED 3.2ul。加入TEMED混匀后立即灌胶,用1ml枪头沿着玻板上沿从左至右轻轻将胶打入,以免胶浓度不均匀,避免气泡产生。加完后换200ml枪头从左至右更加小心加入蒸馏水水封,以免冲散刚灌的分离胶。静置,当水和胶之间出现一条水平的折线时,即已凝固。

2.待分离胶凝固后,将水封的蒸馏水倒出,可将滤纸条放于玻板角吸水加快残留水流出,倒置。配制4ml 5%分离胶,依次向小烧杯中加入蒸馏水2.7ml,30%丙烯酰胺670ml,0.5M•pH8.8 500ul,10%SDS 40ul,10%AP 40ul,TEMED 4ul。加入TEMED混匀后立即灌胶,同上用1ml枪头从左至右轻轻加入浓缩胶,加满后冲洗10孔梳子,水平轻轻插入浓缩胶中静置待其凝固。可将剩余的浓缩胶沿着梳子加入玻板中以完全密封。

3.此时,可将之前分装好的煮过的加入loading buffer的蛋白样品、预染的蛋白maker 和一小支loading buffer 置于4℃融化。

Little Trick

1.AP和TEMED均为神经毒性、致癌物质,使用时需小心。

2.灌胶时视线与胶面水平,注意操作,避免胶溅入眼睛中。

在一个月黑风高的夜晚,北京时间22:00,我独自一人在空荡荡的实验室中配胶,刚好使用了一个枪头口有问题的1ml蓝枪头。说时迟那时快,浓缩胶从枪头口的小洞倏地喷到了我的眼睛中。我立即脱掉手套,洗干净手,用大量清水冲洗眼睛,祷告眼睛别出什么问题。从此以后,每次灌胶我都戴上眼镜。

3.常温下半小时胶可凝固,若天气寒冷或需加快凝固,可将其置于37℃孵箱中,15min左右即可凝固。

4.若第二天早上立即跑胶,这样就不耽误午饭时间,可头天晚上先把胶配好,凝固后取下玻板,连夹子、梳子一同放入蒸馏水中,4℃过夜保存。

(三)电泳:

1.将玻板卡紧电泳槽中,先在内槽加满已配好的1×电转液,十几分钟后观察是否漏液,若漏液重新调整玻板,再次卡紧,直至不漏液为止。否则,可能胶还没跑完,电转液就漏完了。

2.轻轻拔去梳子,第一孔加入5ul预染的蛋白maker ,2~7孔依次加入20ul待测蛋白样品,第8孔加入10ul提前融化的loading buffer。上样时轻轻加入,注意不要将样品加入其他孔,或加样过快导致样品溢出。

3.插好正负极,注意检查正负极不能插反。调节电压至80V(浓缩胶),跑0.5h后;将电压调至100V(分离胶),约1.5h后,maker分离明显,在胶底部出现一条蓝色的buffer条带,此时电泳完毕。使用完在实验仪器使用本上做好登记。

注意:避免蓝色条带跑出分离胶,这样有可能目的蛋白也已经跑出,所以在分离胶底部出现一条整齐水平的蓝色条带时,即停止电泳。

Little Trick

1.电泳时插好正负极后,从电泳槽底会有小气泡上升,气泡的数目和上升速率与电压大小呈正比。若小气泡和往常不太一样,观察几分钟后还是如此,则需检查是否加错了电泳液,或者电泳液配制有误。

2.一般浓缩胶80V 0.5h,分离胶100~120V 1~1.5h,具体跑胶电压和时间与目的蛋白大小、实验仪器和实验室环境都有关,需多次探索最佳条件。若目的蛋白较小,则尽量缩短跑胶时间,并及时观察maker位置,避免目的蛋白跑出。我分别实验了浓缩胶80V 0.5h,80V 1h,分离胶120V 1.5h,120V 1h,100V 1.5h,100V 1h,110V 1.5h,110V 1h,结果显示在本实验室实验仪器下,我的目的蛋白及内参在浓缩胶80V 0.5h,分离胶100V 1.5h条件下,分离效果最好。在此条件下,我做了几次重复实验,结果均一致。因此,总结出本实验室此目的蛋白的最佳电泳条件。

3.电泳的好坏直接影响到目的蛋白的显影情况,尤其时磷酸化目的蛋白的二聚体,若电泳条件优化,结果可清晰显出蛋白表达情况。所以探索最佳电泳条件是决定胜负关键一步。

4.电泳快结束时即可准备转膜所需的滤纸和PVDF膜,浸泡在电转液中。建议在第一次WB后分别剪好不同大小的硬纸片,标好面积和孔数(即样品数),存好以后随时使用。

5.WB中夹取PVDF膜最好使用平头镊子,并夹住膜左上角,可最大程度减小对膜上蛋白的损害。

(四)切胶:

电泳结束后,取出玻璃板,稍微冲洗,洗净电泳槽,放好。轻轻撬开玻璃板,根据maker位置和目的蛋白分子量大小在玻璃板上切胶,为了防止切歪,可在玻璃板下垫上上述剪好的同切胶大小一致的硬纸片。一般一块胶需切下目的蛋白和内参两小块胶,将切下的胶分别浸泡在电转液中。

(五)转膜:

1.根据每一块切胶的大小剪6张同样大小的滤纸和一张PVDF膜,浸泡于电转液中,可以提前准备好的硬纸片为模板剪。PVDF膜先经甲醇活化20s后浸泡于电转液中。

2.在电转仪上制作“三明治”结构转移膜,最下面放三层滤纸,然后依次放PVDF膜,胶,三层滤纸,用玻璃棒轻轻赶走气泡(注意上下三层滤纸之间不能接触,否则易造成短路)。盖上盖子,根据膜的总面积调整电流,电转2h。

3.在电转的同时,可以配制以下液体,事先根据膜的数量计算好所需体积:

以一块膜为例,封闭5ml+稀释一抗4ml+稀释二抗4ml,需要13ml,则配制15ml。

5% BSA溶液(w/v):配制15ml 5% BSA溶液(w/v),称取0.75g BSA晶体,溶于15mlTBST中,漩涡振荡器混匀,现用现配,4℃保存(若目的蛋白为磷酸化蛋白时配制)。

5%牛奶(w/v):配制15ml 5%牛奶(w/v),称取0.75g脱脂奶粉,溶于15ml TBST中,漩涡振荡器混匀,现用现配,4℃保存。

1×TBST洗液:使用时将100×TBST用双蒸水稀释至1×,常温保存。

Little Trick

1.关于电转膜,有些使用NC膜。我没有尝试过NC膜,但隔壁实验室使用NC膜多次WB结果仍不理想,换用PVDF膜后有所改善。因此建议还是使用PVDF膜,可购买Millipore的PVDF膜,一卷有些贵,但是可以够一个实验室用好几年哪。最好不要在经销商购买分装的的PVDF膜,另一实验室一同学想着价格便宜也就只做几次,就从试剂公司只买了100cm2的膜,结果这价格虚高不说,而且膜还是假的,直到做完实验了才发现,蛋白样品也浪费了。所以建议还是购买Millipore公司原装的PVDF膜。

2.关于电转方式,有些采用湿转,有些采用半干转,两种方式均可。个人觉得半干转方便简捷些。

(六)封闭:

1.电转结束后,根据maker位置和目的蛋白及内参大小剪膜。可在标有maker的一边左上角剪一个小角,以清楚哪一条带是1号样品。

2.分别用已配好的5% BSA和5%牛奶封闭目的蛋白和内参,室温摇床上孵育2h。根据盒子大小,加入封闭液的量需没过膜。

(七)孵育一抗:

1.配制p-STAT1一抗(SAB公司),1:500稀释,加入上述配制的5% BSA 4ml,再加入8ul p-STAT1一抗,混匀,现配现用。

配制actin一抗(康为世纪公司),1:2000稀释,加入上述配制的5%牛奶4ml,再加入2ul actin一抗,混匀,现配现用。

2.将PVDF膜从封闭液中取出,可用平头镊子小心放入塑料手套的手指中,加入一抗,封口,使膜完全浸泡在一抗中,放入冰箱,4℃过夜。我一般用封口膜做成小盒,置于大玻璃平皿中,放入PVDF膜,用枪从上到下向膜上加一抗,完全浸没,之后和PCR上样仪一同固定在摇床上,4℃孵育过夜。

(八)次日,回收一抗,做好标记,-20℃保存,可再使用3~4次。将膜放入1×TBST中,摇床上清洗三次,每次10min。

(九)孵育二抗:

1.配制具有种属特异性的HRP标记的二抗(抗鼠或抗兔),1:2000稀释,加入上述配制的5%牛奶4ml,再加入2ul 二抗,混匀,现配现用。

2.TBST洗完膜后,加入二抗,室温摇床上孵育2h。

(十)显影:

1.二抗孵育完后,回收,-20℃保存。1×TBST摇床上洗膜三次,每次10min。

2.一条目的蛋白即一张膜需要100ul发光液A和100ul发光液B,根据膜数计算用量,提前4℃混合好发光液A和B。

3.到暗室中加混合好的发光液,在胶片左上角剪一小角(和PVDF膜一致),曝光胶片,可分别不同时长曝光,如15s,30s,1min,5min等,然后在显影液和定影液中显影,放入自来水中。出暗室后,将胶片挂起晾干。

也可用Bio-rad凝胶成像系统照相,选择不同的曝光时间成像。

Little Trick1.需通过不同曝光时间探索某蛋白最佳曝光时间,多次重复实验即可采用此曝光时长。我最开始也是在暗室中显影,后来用Bio-rad凝胶成像系统照相,对比结果发现后者的结果更加清晰明显,背景也更加干净,之后就一直用成像仪曝光照相了。

2.夹取胶片可用普通镊子,但也只夹胶片左上角,避免损害胶片上曝光的蛋白条带。

3.胶片左上角maker一侧一定要剪一小角或做其它标记,才可在显影后明显对应各个样品。

4.若暗室曝光,可能内参蛋白发光液刚加上就出现很亮的条带,这时最长曝光15s已经足够。

(十)膜重生:

若显影效果不好,可将膜重生,再次显影,省去了配胶、电泳和电转等步骤。

1.加4ml蛋白印迹膜再生液,室温摇床30min。

2. 1×TBST洗3次,每次10min。

3.5% BSA或5%牛奶封闭2h。

4.一抗4℃孵育过夜。

5.次日1×TBST洗三次,每次10min。

6.二抗孵育2h。

7.1×TBST洗三次,每次10min,曝光成像。

(本实验室使用的100×TBST、二抗和白印迹膜再生液均购自康为世纪公司)

但是我实验几次膜重生后的结果并不理想,所以还是乖乖从头开始做WB。


Western Blot只是众多科研技术方法中的沧海一粟,只要肯探索,肯总结,终会守得云开见月明。

真理本身就是不断探索、不断重复的过程。

科研也就是一件幸福有意思的事,不是吗?

最后

祝愿大家

都能跑出漂亮的条带

都能拥有自己的“个性化Protocol”

都能年年发paper

*版权所有,如需转载请后台联系,并注明出处。微信公众号:折耳根说

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 160,333评论 4 364
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 67,812评论 1 298
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 110,016评论 0 246
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 44,293评论 0 214
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 52,650评论 3 288
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 40,788评论 1 222
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 32,003评论 2 315
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 30,741评论 0 204
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 34,462评论 1 246
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 30,681评论 2 249
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 32,168评论 1 262
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 28,528评论 3 258
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 33,169评论 3 238
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 26,119评论 0 8
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 26,902评论 0 198
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 35,846评论 2 283
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 35,719评论 2 274

推荐阅读更多精彩内容

  • http://www.jianshu.com/p/7f4bb8768f76# 缓存的四种方式?各自应用的场景? h...
    toplee阅读 328评论 0 2
  • 如何让管理出效益,从根本上解决人的问题? 各岗位薪酬如何合理分配,(业务型、中层、高层),不同岗位薪酬的设置原则和...
    单衫杏子白阅读 118评论 0 0
  • 这是创意之旅“心灵对话·写作”第九篇文字。 今天不知写什么,之前写了一个关于“忙”的主题,关键时刻断片了,左思右想...
    鏡如阅读 209评论 2 0
  • 院里的春梅到了该绽放的时节,愿我莫再错过花期,辜负岁序美意。你看,时光往返自如,无情无爱,不必牵附于人,亦无须挂碍...
    盘古大观阅读 1,935评论 16 36
  • 三十岁是个分水岭,开始懂得人生的例外会逐个被击破,开始接受多动脑慎走心的感情,那是大部分男女到了这个年纪都会被传染...
    波西米亚的游鱼阅读 406评论 0 3