据《资治通鉴》卷第一百九十八《唐纪十四》载，公元645年唐太宗的这次御驾亲征，唐军被困在高句丽的安市城，江夏王李道宗献策，派兵偷袭平壤，以调虎离山之计将安市城高句丽军引向平壤一线，以攻取安市城。因为唐太宗李世民在军中，李世民的儿女亲家长孙无忌恐伤及唐太宗，极力劝阻，不敢偷袭平壤，未成。加之唐王朝攻击平壤的主将李勣大放厥词，破城之日，屠杀城内军民百姓，以至于平壤守城将士更加齐心合力，此后久攻不克，后值冬天大雪，天气寒冷，唐军劳师远营，粮草严重不济，不得不撤退。途中，李世民对刚刚被提拔的游击将军薛仁贵说：朕旧的将领都老了，不能承受战地指挥的繁重工作，每次都想提拔骁勇雄健的将领，没有比得上你的，我不高兴于得到辽东，我高兴得到你啊。唐军回到长安后，李世民又提拔薛仁贵为右领军中郎将，镇守皇宫北门，即历史上著名的玄武门。 唐高宗永徽五年（公元654年）五月初三夜，长安城南的秦岭突发暴雨，山洪崩发，汹涌的洪水裹着泥沙一直冲至禁苑皇宫太极宫北宫的宫门，守卫将士尽皆抱头鼠窜。薛仁贵愤怒道：哪里有天子情况紧急立即就怕死逃跑的？然后他只身冒死登门框向皇宫高呼，警示内宫，唐太宗驾崩后继位的唐高宗李治因此得以避过这场灾难。稍倾，洪水淹没李治的寝宫，李治感恩道：幸亏是你啊，朕才避免被淹没，朕才知道朝中还是有忠臣啊。于是赐给薛仁贵一匹御马。 唐龙朔元年（公元 661年），一向与唐友好的回纥首领婆闰死，继位的比粟转而与唐为敌。唐高宗李治诏郑仁泰为主将，薛仁贵为副将，领兵赴天山击九姓铁勒。临行，李治特在内殿赐宴。席间，李治对薛仁贵说：古代有善于射箭的人，能穿透七层铠甲，你射五层看看。薛仁贵应命，置甲取弓箭射去，只听弓弦响过，箭已穿五甲而过。李治大吃一惊，当即命人取坚甲赏赐薛仁贵。郑仁泰、薛仁贵率军赴天山后，九姓铁勒拥众十余万依据天山排兵布阵，并令骁勇骑士数十人前来挑战唐军。薛仁贵临阵发三箭射死三人，其余骑士慑于薛仁贵神威都下马请降。薛仁贵乘势挥军掩杀，九姓铁勒大败。接着，薛仁贵又越过碛北追击敌人，擒其首领兄弟三人。薛仁贵收兵后，军中传唱说：将军三箭定天山，壮士长歌入汉关。从此，危害西域近两百年的九姓铁勒衰败，不再为患边关。宋代诗人辛弃疾在《江神子·和陈玉和韵》一词写道：却笑将军三羽箭，何日去，定天山 。 唐高宗麟德三年（公元666年），高句丽国由于老王驾崩，新王和兄弟发生内讧燃起战火，在高句丽国新一届政府的多次邀请下，唐王朝派兵进驻。9月，薛仁贵先统兵出征，12月又大举出兵，由李勣统管诸路兵马合击高丽。公元667年，李勣兵取高丽军事重镇新城（今辽宁抚顺北高尔山城），并趁势将附近的16座城池全部攻下。新城是一个战略重镇，也是整个战场的军事要冲，地理位置特别重要，而身经百战的“纯臣”李勣居然鬼使神差犯了常识性错误，疏忽了对刚打下来的新城的防守，高句丽反政府武装头目泉男建率大军夜袭唐军营，新城危在旦夕。薛仁贵闻讯后率队狂奔杀到，如神降天兵，把处于劣势的唐朝军队转为优势，倒过来斩杀敌人数百人，解救了新城之围，挽狂澜于未倒。接下来，薛仁贵迎来了快意恩仇的四大战役，也就是历史上彻底消灭高句丽的四大战役。在平壤的金山、扶余两大战役中，消灭有生力量最多的金山之战和破城最多的扶余之战，这两战都是由薛仁贵独立打胜，他个人奋不顾身冲入敌阵对战役最后胜利起到了决定性的作用。在金山战役中，唐军李勣所部遭遇了十万高句丽精锐之师，被打得一败涂地。高句丽军正乘胜追击唐军的时候，斜刺里却杀出了英勇无比的薛仁贵部兵马，把敌人拦腰斩断，完全没有防备的高句丽军队顿时慌了手脚，这一战直杀得日月无光血流成河，高句丽军最后溃不成军，被斩首五万（不算逃跑受伤的人），金山之战是唐王朝建国后罕有的一次大规模遭遇战，也是灭掉高句丽四大战役中最关键的一次战役，此役消灭了高句丽最精锐的部队，为彻底取得征服高句丽的胜利奠定了重要基础，从此以后唐朝军队在高句丽战场上势如破竹，薛仁贵高超的指挥才能在这四场战役中得到了淋漓尽致的发挥，这极大地鼓舞了唐军的士气和信心。同年11月，薛仁贵仅带两千兵马进军扶余，用不到15个小时的时间歼灭了敌军一万多人。时值北方的隆冬季节，薛仁贵的两千军士都学主将一样身着白袍冲锋陷阵，像飞翔的雪花一样飘逸至白茫茫的远方大地，对面的敌人还以为是雪崩，几万敌军就这样被冲得七零八落，溃不成军。《资治通鉴》上说此役是古代战争史上最早用迷彩服保护色进行战斗的战役，其军事创举堪称首开先河。 唐总章元年（公元668年），薛仁贵率部攻下了固若金汤的扶余城，从此高句丽无险可守，连续有40多个城市相继向薛仁贵举起白旗，唐朝军队自此可以自由自在饮马鸭绿江边。从此高句丽人闻薛仁贵色变，孩子一哭吓唬他薛仁贵来了立即噤若寒蝉，不敢再哭，薛仁贵声名鹊起。史载，高句丽国王签投降书时连正眼都不敢看薛仁贵。中原地区自汉唐以来几代帝王征服高句丽的梦想在薛仁贵的手上成了现实。 高句丽归降，唐朝分其境为九都督府、四十二州、一百县，并于平壤设安东都护府以统之。诏命薛仁贵率兵二万人与刘仁轨留守平壤。薛仁贵以功授右威卫大将军，封平阳郡公，兼检校安东都护。薛仁贵留守平壤后，疏通河道，抚养孤儿，赡养老人，治理盗贼，提拔任用德贤人才，表彰奖励品德高尚、行为优异的百姓，一时间高句丽举国老百姓都喜悦得奔走相告。
