k8s中mongo容器数据迁移之内存小坑

  近日在进行mongo的数据迁移,使用mongodump及mongorestore工具,遇到了导出正常导入失败,无报错日志,容器退出码是137,直接容器自行重启了。现简要说说是可能是什么原因。

环境信息

  源环境:mongo v3.4.10,数据量磁盘存储是3-4GB,使用mongodump不加--gzip参数时有19GB,加--gzip参数后是2GB。以单pod形式运行在A网络区的k8s集群中。
  目标环境:mongo v3.4.24,以单pod形式运行在B网络区的k8s集群中。
  操作:将数据从源环境迁移到目标环境。

操作过程及遇见问题

  1. 使用mongodump -o XXX导出数据,未发现异常;
  2. 使用mongorestore XXX时,运行到80%左右,程序直接退出,且会使pod自动重启,提示:
Failed: XXXX: error restoring from XXX/XXX/xxx.bson: insertion error: EOF
command terminated with exit code 137

排查过程:

  1. 网上搜上面异常,大多都是说mongo v3.0.7有这个缺陷,可是我们当前版本比它高,应无此bug。
  2. 排除mongo版本不一致:再去测试环境重新导入导出一次,难道是mongo不支持在线的导入和导出?在测试环境试后,测试环境可以正常导入导出,mongo版本也是一样的,因此跟版本应无关。
  3. 排除数据异常:网上查了下,mongodump是在线备份的,那么使用--gzip参数,将导出文件压缩下,然后再恢复,发现还是一样的错误,说明数据在导出、传输时没有问题。在不同小版本间mongodump和mongorestore工具的文件大小有大差异,未深入研究其原因。
  4. 排除空间不足:检查新环境文件系统,发现文件系统是完全足够的。
  5. 逐个数据库导出/导入,诊断问题出原因:上面报错之前显示了导入的具体库名及集合名,那这次单独导入就拿它试验;
    导出命令:mongodump --gzip -d xxx -o XXX/
    异常导入命令:mongorestore -d xxx --stopOnError --drop XXX/
    此时导入报错,说遇到XXX/xxx后不知道该怎么处理,于是就忽略XXX/xxx文件夹,程序就直接结束了。可是XXX/xxx刚好就是导入的库的路径啊。这又是何原因呢?
    对于小白来说,遇到这种不知所云的报错,真是头疼,只有不断尝试,把XXX/修改成XXX/xxx,然后再跑,此时通了。
    成功导入命令:mongorestore -d xxx --stopOnError --drop XXX/xxx
    不过此时导入依然是导入到80%左右报最开始的错误。
  6. 排除连接数问题:无意中搜到MongoDump与MongoRestore若干小坑,于是检查链接ulimit,发现是不受限制,然后再尝试导入,同时观察db.serverStatus().connections,发现也是足够的,离满还差得远。

问题原因

  由上面检查连接数,延伸到是否其它资源不足导致pod退出呢?而pod的资源主要就是CPU和内存(文件系统已经检查过了)。
  核查完pod的CPU、内存后,发现CPU的最高使用率没有接近或超过yaml里设定的limits,而内存实际使用有16GB,yaml里limits限定是18G,已经很接近了。那么是否可能是内存不够了?
  重新扩大yaml的内存limits为25G,然后再重新导入,导入成功!
  此时再检查该pos内存使用率,发现最高使用到23GB了。

总结归纳

  本人不是专业搞mongo的,本次是初次使用,因此,可能本问题比较简单,但还是记录下来,以备后用。
  初步猜测导入时的内存大小与导出时最大的单个bson文件大小有关。本次迁移中,单个bson文件最大是18G,而考虑到额外空间,内存至少得18G+以上。时间有限,未做进一步的测试验证。

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