拉普拉斯的魔女是东野圭吾先生作家生涯30周年完成的，他说：“我想摧毁自己以前写的小说，于是，这部作品就此诞生。”不得不承认，从摧毁这个角度来说，这本书算是成功的。
故事从一位年过六十的著名导演水城义郎在温泉吸入硫化氢中毒身亡展开，死前，他和只有三十岁的貌美如花妻子在一起。
接下来故事路线分为三处贯穿进行。
1，中冈佑二，身份警察
本来水城之死被认定为一起意外事故似乎合情合理，因为温泉胜地时不时会从地下释放出硫化氢，水城很可能误入浓度特别高的地方。然而引起中冈特别关注此次事件是因为，三个月前他收到水城母亲寄往警局的信。大致内容是，怀疑小儿子近四十岁的媳妇是为财而来，很可能伤及儿子生命。
中冈深入调查，找到专家青江，寻找可能构成他杀的方法。接着调查和被害相关人，发现小媳妇曾经找过地下暗黑网站，再加上吊唁上小媳妇满带自信的笑容，于是被认定此事有蹊跷。
由于青江的提醒和推测升级，中冈多方走访，发现甘粕才生并非展现大众面前的自己，而是在妻子女儿死后通过杜撰故事重塑心中的家庭关系为了将来拍成一部惊世大作。至此，警察的工作完结，因为上头发话不能继续插手此事。
2，青江修介，身份环境和化学方面大学教授
被邀请给予硫化氢浓度现场专业解释的专家，恰好住在被害人相同酒店，恰好遇上羽泉圆华，恰好听到老板娘说事发之前有一位遇到一位年轻男生两次。同时最最重要的个人品质，重度好奇心和爱推理患者。
不久之后，被报社记者邀请去L县解释另一起硫化氢中毒事件。从此以后，由专家转变为一个好奇宝宝和热心肠。接下来又一次恰好遇上羽泉圆华，恰好聊上天，恰好互留电话，恰好成为相互信任的人。然后是通过搜寻两起事故的被害人，寻找二者之间联系，接着找到羽泉圆华的父亲曾经手术治愈过一起植物人事件。
恰好此时中冈出现，青江将自己的推测全盘托出。二人互通手中的信息和推测，发现羽泉圆华在找甘粕谦人。
接下来青江发现中冈没有如前所述和他互通有无，决定自己亲自出马搞清事情真相。一切就此开始真相大白，在和羽泉圆华的两次见面中，将事情来龙去脉摸清，且彼此成为互相信任的朋友。
3，羽原太郎，身份某大学脑外科博士，脑神经细胞再生方面权威
有一女羽泉圆华，妻子多年前死于一场突如其来的龙卷风。曾经通过手术，成功治愈一名因硫化氢中毒而成为植物人的男生，甘粕谦人。并且为了科学研究，在女儿脑中活体再现了脑神经再生的奇迹。使得谦人和圆华都具有自学习大脑功能，可以通过周围湿度、速度等因素推测可能发生的天气变化可能的液体流向等。
简单来说是大脑实现拉普拉斯假说，假设有智者能够了解这个世上所有原子的目前位置和运动量，他就可以运用物理学，计算出这些原子随时间发生的变化，进而完全预知未来的状态。
甘粕谦人不为人知的故事是他的有性格缺陷的父亲甘粕才生杀死自己妻子和女儿，同时造成儿子植物人。而这些温泉地硫化氢中毒事件都是谦人为了最后杀害父亲所布下的前期工作，他的方式是利用自己大脑高速分析测算能力预知适合的天气和地形，辅助必要的设备，拉上帮凶，实现被害者意外死亡的现场。
嘈点在哪里？
青江修介是整个故事中揭开谜团最重要的人，他具有权威人士的责任感，严禁的逻辑推理能力和锲而不舍且难以被满足的好奇心以及对陌生人的完全信任。
毫无冲突的情节还原以及毫无保留的对话，这样的对话在青江和羽泉圆华中也多次出现。试想两个毫不相干的人因为在事发地两次偶遇，可以毫不忌讳的告之事情原委甚至国家机密。
“动机呢？甘粕谦人为什么要杀人？”青江问桐宫玲
“这。。。”桐宫玲说到这里，摇了摇头，“不能告诉你，因为和你没有关系。”
“都已经说了这么多了，却突然卖关子，请你告诉我。”
大脑实现拉普拉斯假说。拉普拉斯变换和拉普拉斯方程是大学数学必学内容，一般通过对函数的拉式变换可以获得一些近似求解，多用于分析电子电路、谐振子及机械设备等。如果，大脑实现拉普拉斯成为可以快速运算且具有自学习功能的超级计算机也不失为一个好的科幻小说素材。然而结合现实只是用不那么高明的手段去报复有缺陷的父亲，而且报复者本身同样被遗传这部分内心缺陷。
说到底，整个故事把所有说不通的地方用缺陷和超能力来解释就让人喜欢不起来。
