这个需求真的太常见了!注意问题强调的几个关键词:一是快速,二是大量,三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本,比如宏基因组中的物种分析: 方法一:自定义 自定义...
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首先声明下面整理的内容都来自于网络,并在文末注明了引用的出处,本内容仅用于学习交流,禁止用于商业用途,如有侵权,请联系删除。目前自己常用的调色R包有: ggsci[http:...
1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度:某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一般而言,随着测序深度的增加,基因种类以及可变剪接体的数目也会...
本节来介绍如何使用 element_blank() 来控制ggplot2 图像的外观 依旧还是使用企鹅的数据集 1. 删除主要网格线 2. 删除次要网格线 3. 删除图像背景...
记住是summarize函数而不是summarise函数 summarize函数可以进数据框折叠成一行 计数本质上返回的是分组后的行数 group_by为分组函数,是如果我们...
本节来介绍dplyr中的重要函数count,summarise,group_by count count 统计观察次数 也可以在一个count()语句中添加多个变量 summ...
前面的2节介绍了数据的格式转换宽表转长表函数pivot_longer以及行过滤函数filter( )今天来继续介绍列选择函数select( )的使用 选择列:基础 要选择几列...
1.问题 今天利用R写循环的时候出现了一个问题,循环内会产生多个数据框,希望将这多个数据库合并并生产一个最终的数据框,最后利用了list和do.call()功能进行了实现。 ...
ggplot2基础(5)——配色与图例 参考《R数据可视化手册》、《R绘图:一文了解ggplot2颜色的设置[https://zhuanlan.zhihu.com/p/148...
pheatmap交互 最近ComplexHeatmap更新可以将pheatmap对象进行参数转换。新增的ComplexHeatmap::pheatmap()的功能与pheat...
热力图(Heatmap)是统计学习中不可或缺的图形之一,在生信领域中尤为常见,它通过颜色的深浅程度来判断不同类别间的差异,通常结合数据特征的相关系数矩阵来判断其显著性。此外,...
手肘法 - 核心指标:SSE(sum of the squared errors,误差平方和) Ci是第i个簇 p是Ci中的样本点 mi是Ci的质心(Ci中所有样本的均值) ...
适用背景 在R语言中,我们需要对字符串、向量和数据框等数据类型进行替换操作,有时候是因为需要更换别名,有时候是因为数据存在错误需要修正,有时候则是因为需要删除某些信息。本文将...
简介 plot1cell包提供了多种单细胞数据可视化的高级功能,可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图,主要依赖于Seurat V4,circlize,Compl...
myplot:Gracefully Saving Base R Graphics like ggsave English help please see: https://g...
1.图片保存 图片保存的几种方法: 1.1 基础包作图的保存1.2 ggplot系列图(包括ggpubr)通用的简便保存 ggsave1.3 pheatmap函数的图保存方式...
前言 在前面一节中,我们主要介绍了如何使用 grid 来生成图形输出,以及图形窗口的布局。利用这些知识,可以很容易地为图形添加注释,编写一些简单的绘图函数 这一节,我们将重点...