生物信息与育种

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NAR | 华大和上海师范大学开发的基因组选择平台CropGS-Hub
几个月前就听说华大万物联合上海师范大学开发了基因组选择的工具CropGS，一直比较好奇。近日文章已经发表见刊，得以一窥究竟。 [图片上传失败.....

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又双叒叕一个大豆T2T基因组发表了
前不久才刚总结完大豆T2T基因组：哪个才是首个（中国）大豆的T2T基因组版本？[https://mp.weixin.qq.com/s/WOJT3...

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国家生物信息中心和表型组学研究中心公开植物图像及相关性状开放归档库OPIA
植物图像承载着丰富的信息，反映了植物的颜色、形态、生长和健康状态等关键特征。高通量植物表型采集技术广泛用于植物表型组学研究，产生了大量基于图像的...

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国际水稻所为你提供了一套免费开源的表型育种数据分析流程
背景每年国际水稻所（IRRI）的雨养稻育种（Rainfed Rice Breeding,RRB；所谓雨养就是无人工灌溉，仅靠自然降水作为水分来...

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fastsimcoal基因流和种群历史动态可视化解读
参考大型基因组SLAF-seq蕨类植物孢子强扩散能力下生态适应塑造的遗传分化格局Ecological adaptation shaped th...

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R语言模型部署方法总结
模型部署概述数据科学项目的生命周期通常以迭代方式执行以下主要阶段：业务理解（Business understanding）数据采集和理解（...

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康奈尔大学生物信息中心主任关于基因组组装报告
Dr. Qi Sun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任，长期以来从事生物信息学工作，在大数据的管理与分析上，特别是Genotype-By...

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如何快速纠正VCF文件中REF和ALT的位置错误？
需求描述一个很简单的需求：一批水稻材料的芯片数据（位点少），想看看它们在3K Rice中处于何种亚群和位置。就需要将芯片位点与3K RG位点整...

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植物基因组学和作物改良中的深度学习
植物基因组学取得了巨大进步，其特点是高通量技术的爆炸式增长，以低成本识别多维全基因组分子表型。更重要的是，基因组学不仅仅是获取分子表型，还利用强...

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