基因的可变剪切造就了转录本的多样性,作为一种常见的基因表达调控机制,对于生物体的生长、发育和适应环境等方面都具有重要作用。前面写过一篇关于bulk RNA-seq的推文,...
基因的可变剪切造就了转录本的多样性,作为一种常见的基因表达调控机制,对于生物体的生长、发育和适应环境等方面都具有重要作用。前面写过一篇关于bulk RNA-seq的推文,...
写在前面 这里我将chip-seq&ATAC-Seq的分析分为了上游和下游两个模块,但是都只是介绍了常规的分析流程。因此,在面对具体课题的下游分析时,仍需要根据自己想要探究的...
LEfSe的分析原理 LEfSe主要通过以下三个步骤实现生物标记物的鉴定: Kruskal-Wallis秩和检验 首先对每个物种/基因进行Kruskal-Wallis秩和检验...
0.背景知识 TIDE评分越高越容易发生免疫逃逸,免疫治疗获益的可能性就越低,评分>0视为无响应,<0视为有反应。 只有网页工具和python版。网页工具需要注册登陆使用,普...
CheckM 提供了一套用于评估从分离株、单细胞或宏基因组中获得的基因组质量的工具。它通过使用在系统发育谱系中普遍存在且单拷贝的基因组来提供对基因组完整性和污染的可靠估计。还...
文献信息:标题:Distinct gut metagenomics and metaproteomics signatures in prediabetics and tre...
首先,目前肠道微生物联系最紧密的三种代谢产物是氨基酸、短链脂肪酸或胆汁酸,以这三种代谢产物做靶向检测与微生物组学做关联分析也占绝大多数。否则,便需利用代谢组广筛方法,得到差异...
Introduction 宏基因组(Metagenome)是指对一个生态系统中的所有微生物进行DNA分析的过程,可以帮助研究人员了解微生物的多样性、功能和互作关系。 宏基因组...
宏基因组技术的出现改变了微生物研究的方式,其减少了对微生物培养的依赖,通过无偏倚的方式实现更快速的物种检测和新物种的发现。由于宏基因组是从复杂样本而不是单一物种中获得基因组信...