240 发简信
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    问卷数据的效度与信度分析

    李克特量表是调查问卷中经常使用到的表格形式,它将一组指标分为五个等级:非常赞同、赞同、一般、不赞同、非常不赞同,分别计分为5、4、3、2、1。对...

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    snakemake搭建生信分析流程

    参考文章:https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/85330457https://ww...

    2.3 3993 0 16
  • samtools 工具

    参考文章:https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html1、view主要功能:sam和bam...

    1.0 5042 0 15
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    基因在肿瘤与正常组织中的表达(TCGA)

    今天给大家介绍一款R包:TCGAExpression, 可以检索基因在33种肿瘤组织 vs 正常组织中表达。顾名思义,这个包功能实现是基于TCG...

    1.2 7461 2 13
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    RNAseq分析流程:从测序Rawdata到Count输出

    在之前学习snakemake的基础上,这里重新又对之前编写的pipline进行了优化,只需要在config.yaml中输入相应的samples,...

    1.4 3622 0 13
  • 手把手学会TCGA数据分析

    在windows系统上进行TCGA数据的自定义分析,需要: 1,gdc-client,TCGA官网的下载工具专门用来下载TCGA中的数据; 2,...

    0.7 8583 2 13
  • R语言提取TCGA数据库clinical.json中的临床信息

    转自“医学统计园”微信公众号。 读入clinical.json文件 计算文件长度n,在这里n为348 初始化变量 利用一个for循环由json文...

    0.9 7702 5 12
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    CCLESearch数据库使用

    很久没更新过简书的文章了,今年到目前为止,这是第三篇简书文章,实在是惭愧。 最近周末得空,就借助CCLE公开数据,在自己服务器上搭建了一个数据检...

  • 对miRNAs靶基因进行批量预测

    1.提取miRNAs 2. 由starbase API数据库进行下载(10s检索完成) 3.将所有的miRNA靶基因进行合并整理 每个文件都有这...