240 发简信
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    高颜值火山图绘制脚本

    分析背景     火山图常用于转录组研究中,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一种,它能将统计学中的统计显著性...

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    一文学会质粒图谱绘制工具——SnapGene viewer

    背景知识     SnapGene viewer 是SnapGene 的免费版本,虽然它删减了一些功能,但对于初学者来说依然很实用哦。SnapG...

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    快速从FASTA文件中提取特定序列

    最近有个老师在做基于十多个保守基因的进化树分析,需要从几十个基因组中分别提取出特定的基因序列,如果对于每个基因都是“查找基因ID-复制基...

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    GEO数据快速下载

    1.简介 俗话说“巧妇有无米之炊”,学习生信分析最重要的就是需要数据,作为刚入门或即将入门的生信小白来说,数据无疑是学习生信技能最大的阻碍了。虽...

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  • Aspera——数据下载必备神器

    Hello! Hello! 小伙伴们大家好,我是豆豆,好长时间没有和大家见面了。最近小编在做数据挖掘分析的项目,需要从EMBI、NCB、 Ge...

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    快速绘制Upset图

    分析背景     提到集合的可视化,大家第一时间想到的是用Venn图来展示,在前期的推文中,小编也给大家分享了venn图的绘制方法。然而,值得一...

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    TCGA数据下载工具

    简介 在前一篇文章中,小编和大家分享了GEO数据的下载方法,作为GEO数据的姊妹篇,TCGA数据库中的数据也是生信分析常用的数据之一。TCGA(...

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    多维venn图

    研究背景 维恩图(Venn diagram),也称韦恩图、文氏图、温氏图,是利用集合分类的原理将特定的数据进行分类或归类。在生信分析中,Venn...

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    快速计算肿瘤微环境

    研究背景 肿瘤微环境是肿瘤组织或细胞所处的细胞环境,它由免疫细胞,间充质细胞,内皮细胞,具有炎症介质和细胞外基质(ECM)分子[1-2]。在肿瘤...

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