大吉岭猹 - 简书

大吉岭猹

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DoubletFinder 去除双细胞
1. 参考资料 https://mp.weixin.qq.com/s/ybr1rK5CcC-BfDKUYxKcNw https://www.ji...

0.5 12650 0 11
Motif 分析
1. Homer 1.1. homer的安装和配置按照这个链接里的教程进行。 1.2. install mm10 1.3. find moti...

1.9 3796 0 4

ATAC-seq 质控
1. 写在前面 1 年前看技能树在简书的文字教程第一次跑 ATAC-seq 分析流程，当时还很懵懂，以为每一步只有一个工具，现在通过技能树刚发在...

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单细胞数据挖掘3-clustering
1. 写在前面参考教程：https://hbctraining.github.io/scRNA-seq/ 2. Normalization, ...

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技能树直播课程学习-WGCNA-3-模块与临床性状关联
1. 计算 ME 值 2. 计算模块与性状的相关性并可视化 3. 计算各基因表达量与模块 ME 和性状的关系（MM and GS）并可视化 GS...

0.1 1979 0 1
单细胞数据挖掘2-QC
1. 写在前面参考教程：https://hbctraining.github.io/scRNA-seq/ 2. 搭建环境在 Rproj 的位...

0.2 1648 0 4
技能树直播课程学习-WGCNA-2-网络构建和模块检测
1. 挑选软阈值软阈值的要求：无尺度拓扑网络系数 R^2 高于 0.85，或者或平均连接度降到 100 以下如果没有合适的阈值，可以使用 R...

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技能树直播课程学习-WGCNA-1-数据清洗
1. 层次聚类在读入表达矩阵，进行基础的筛选，并使用 goodSamplesGenes() 确保没有太多的缺失值后，我们对样本进行聚类，以剔除...

4.6 2045 0 5
技能树直播课程学习-WGCNA-0-基础知识
1. 基本步骤数据输入和清洗网络构建和模块检测量化模块和样本性状的关系挑出感兴趣模块内部的基因可视化TOM矩阵将网络导出到外部数据进...

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