公共数据库中的SRA 单细胞转录组数据究竟包含了哪些数据？CellRanger怎样利用10x平台下机数据进行下游一系列分析？这篇文章简单记录Ce...

Monocle包构建拟时分析时，关键步骤order()完成了细胞表达基因的排序，并给出了pseudotime值及其他指标，关于这些变量的一些理解...

拿到一串感兴趣的基因，它们究竟参与那些生物学功能，是否与预期相符？最简单的解释办法是通路富集分析（pathway enrichment anly...

产生了各种图表，用最简单的代码组合各图为整体，并作统一修改，就是patchwork拼图包的强大之处。简单介绍patchwork包的主要功能，以备...

如果在GEO数据库上一篇文章包括了多个样本，对应到多个SRR run，那么此时一个批量下载SRR 数据的命令就非常方便了。当然，关键在于，你能获...

文章基本信息 2016年发表于Development杂志，题为Circular RNAs: analysis, expression and p...

给定集合，判定集合间的交集并可视化，是比较不同数据集的一种方法。R语言中有几个包能够较好的完成这份工作。如VennDiagram、Venn、Up...

可视化工具：R包，ggplot，ggplot2，两种可视化变量：类别型、定量型。饼图、柱状图。条形图、散点图、箱线图样本统计值：中位数、均值、方...