salmon是一款不基于比对而直接对基因进行定量的工具,适用于转录组、宏基因组等分析。其优势是: 定量时考虑到不同样品中基因长度的改变(比如不同isoform的使用) 速度快...
使用官方推荐的安装命令 产生如下奇怪的glibc冲突 可是明明2.31大于2.17版本啊,经过查阅,发现可能是conda同时搜索conda-forge和default库产生冲...
参考1:https://www.jianshu.com/p/68f7b663c5ff[https://www.jianshu.com/p/68f7b663c5ff]参考2:h...
BioSciTools https://bioscitools.github.io[https://bioscitools.github.io]基于Java (JDK-11)...
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点: 速度快 准确度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多个比对共享...
The evolution of gene expression levels in mammalian organs[https://pubmed.ncbi.nlm.nih...
1. synteny 和 collinearity 用来描述基因组的共线性 synteny 共线性:同源基因在相应染色体上的保留collinearity 同线性:在synte...
今天分享最近发表的另外一篇文献,还是棉花棉纤维研究的,最近棉花的单细胞文章还真是多,扎堆发表了。 棉纤维的重要性,我就不多做叙述了,我也查百度,就不粘贴了。circadida...
使用单拷贝基因画物种进化树 所需软件: 步骤: python 脚本更改物种蛋白序列的ID 2)更改各个物种蛋白库文件的名字,与序列ID的名字前半部分一致;例如Amborell...
今天我们要复现的是一篇SCI文章的配对连线箱线图,配对箱线图、或者说配对连线图我们之前有写过(ggplot做分组配对连线图[http://mp.weixin.qq.com/s...
参考:zhuanlan.zhihu.com/p/27162794 www.cookbook-r.com/Graphs/Output_to_a_file/ blog.scien...
中心法则: 蛋白相关实验: 基因结构: 研究思路: https://www.bilibili.com/video/BV1Sv4y117ZP/?spm_id_from=page...
0.起因 最近在群里看到一个图,棒棒糖图的点用饼图代替了。 然后又看到一个文章里,用饼图代替了富集分析的点图,妙啊~ 这个地球上有什么漂亮的图能躲过我的小胖手呢?画他! 1....
nohup sh -c '命令行' & nohup sh -c 'for i in *sra; do fasterq-dump --split-3 ${i}; done' &...
在做NGS data处理的时候,常常会遇到需要使用picard和samtools 进行remove PCR duplicates的步骤。在网上查了一下 PCR duplica...