生信工具 - 专题

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文献笔记七十二：Chloroplot~叶绿体基因组圈图可视化的新工具
文章题目 Chloroplot: An Online Program for the versatile plotting of organel...

1.1 小明的数据分析笔记本 2 19
群体结构推断软件FastStructure安装的详细指南
此款软件是基于SNP位点进行群体结构的推断，运行速度比较快一些，本文主要介绍它的详细安装步骤。一、安装fastStructure的依赖包和库：C...

1.1 原本随想 2 13

R可视化：'patchwork:合并多个R图的包'
'patchwork:合并多个R图的包' patchwork是基于gglot2的拼图包，它使得基于ggplot2的图形更容易拼接在同一个图层。更...

0.6 华仔少年 0 11
multiple whole genome alignment
写在前面：在上亿年的进化历程中，基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因组重排和水平基因转移。基因组比...

2.1 扇子和杯子 23 27
R可视化：使用R的circlize包绘制样本-物种丰度关联弦状图
R作图-使用circlize绘制样本物种丰度关联弦状图 circlize图也即是弦图能较好展示样本物种丰度关联关系，先前从lyao222lll博...

2.0 华仔少年 0 11
十节课，BRIG软件带你玩转比较基因组圈图
Hello，小伙伴们，大家好！还在为CG View Server，GeneWiz browser等网址限制比较基因组数目而苦恼吗？...

木小白_d052 0 15
MECAT2: 三代高效组装工具
MECAT2是三代测序数据PacBio的高效组装工具，是之前MECAT的改进版, 修复了之前的很多bug, 使用基于string graph的f...

0.6 xuzhougeng 1 10

NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效...

9.2 wangpeng905 27 195
Sequenza从WES推断出拷贝数概况
Annals of Oncology 26: 64–70, 2015doi:10.1093/annonc/mdu479Published onl...

0.4 共由小兑 4 7
【单细胞转录组】TooManyCells识别并可视化单细胞进化枝
简介： https://www.nature.com/articles/s41592-020-0748-5 https://www.biorxi...

0.7 Geekero 1 5