• RNA-seq的标准化方法罗列

    RNA-seq的标准化方法 对于RNA-seq而言,由于 技术误差, 测序深度不同, 基因长度不同,为了能够比较不同的样本,比较不同的基因的表达量,以及使表达水品分布符合统计...

  • 谈谈我对基因组区块链的看法

    昨天,生信技能树推送了一篇关于基因区块链的文章。刚好,我对基因测序产品和区块链都很感兴趣,所以说几点我的看法。 如果不从区块链属性来看,仅仅认为它在卖测序服务,4999对于9...

  • 1000粉丝记

    我有一个简书账号,hoptop,曾用来当作游戏ID,昨天晚上拥有了第1000个用户。 生活有一定的节奏,但偶尔会有随机事件,如同平缓的水面偶尔也会有涟漪。简书是3年前的账号,...

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    如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析

    如何分析芯片数据 我最早接触的高通量数据就是RNA-seq,后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据,因此我从来没有分析过一次芯片数据,而最近有一个学员在看生信技能树在...

  • 同源注释工具GeneWise安装和使用

    这是一个非常老的软件,距离他不更新至少有10多年了,但是目前还是有很多公司用他进行基因组注释,包括ENSEMBL的注释流程的几个核心部分用到的也是它。 但是他的安装也是异常的...

  • Python标准库re的学习笔记

    Python的正则表达式 Python通过导入标准库re实现正则表达式(regular expression),Python的正则表达式引擎和Perl一样,并且兼容Perl流...

  • 收集免费资源卖给别人,合适嘛?

    前两天Jimmy说有一个非常“无耻”的公众号,收集了大量网上免费的视频课程(这其中就包括他录制收集的大量资料),然后另外开价卖给那些希望学习生信的人,更加“无耻”的是有的人花...

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    基因组survey

    基因组survey 在组装基因组之前一定要先对要组装的物种有一个大致的了解,判断其复杂程度, 标准如下 简单基因组: 杂合度低于0.5%, GC含量在35%~65%, 重复序...

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    如何过滤freebayes得到原始vcf文件

    变异检测算法的核心就是从尽可能找到真实的变异,降低假阳性。尽管目前测序仪器的准确性可以达到99.999%,似乎很高的样子,但是对于高通量测序而言,这意味着在100,000个碱...

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中国科学院植物学硕博连读研究生
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生信媛 第二帅小编
中国首个生信技能入门论坛--生信技能树管理员