背景 查看某些基因在特定癌症里是不是发生了拷贝数变异。 最简单的方法 直接去一些分析网站上查看,当然也有一些弊端,例如数据更新滞后,没有给出明确...
背景 查看某些基因在特定癌症里是不是发生了拷贝数变异。 最简单的方法 直接去一些分析网站上查看,当然也有一些弊端,例如数据更新滞后,没有给出明确...
部分一 第一步、数据下载阶段 第二步:GDCdownload()下载GDCquery()得到的结果 第三步、数据处理 第四步:TCGAanaly...
前言 在介绍完 TCGAbiolinks 的查询下载和数据分析功能之后,我们简单展示几个示例,来练练手,加深对这个包的理解和使用 我们主要从: ...
我之前在简书上转载过别人写的TCGA barcode介绍,这两天碰到相关的问题,我看了看,觉得不是很清晰,再说道说道。 接触和分析过TCGA数据...
说在前面 Immugent在之前一篇推文照葫芦画图之PCA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5O...
首先,简单介绍一下新抗原(neoantigen)的含义,它是肿瘤细胞特异性表达而正常细胞(除了睾丸之外)的一种抗原性多肽, 它能被免疫系统的T细...
癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类:肿瘤相关性抗原(tumor-associatied self-antigen)以及肿瘤特异性抗原(t...
使用cBioPortal进行复杂的癌症基因组和临床profiles整合分析(Y大宽原创,转载需要说明) 主要来自于doi:10.1158/215...
关于随机森林,你要知道: 基于决策树,比决策树更加稳定的分类器 无监督,随机抽取组成小样本。再放回,再抽取,即bootstrap 建树足够多,没...
倾向性评分匹配(propensity score matching, PSM)主要是在随机对照试验(Randomized controlled ...
专题公告
TCGA数据分析