影响因子:11.622 细胞衰老(CS)是一种永久生长停滞的状态,与肿瘤的发生密切相关。由于缺乏特定的标记物,研究癌症类型中衰老水平和衰老相关表...
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小编发现我们经常使用的TCGA数据库,大概在2022年4月初进行了更新。以前RNAseq数据使用的是Htseq-counts,新版本中使用了ST...
前面小编给大家详细介绍过TCGA这个数据库,以及如何从这个数据库下载,合并表达谱数据。然后做差异表达分析,以及构建ceRNA网络。 ☞[http...
鉴于前一段时间有小伙伴私聊 Immugent 说生信宝库是不是专门只写单细胞相关的推文呀,其实,这只是凑巧最近发的都是单细胞相关的。虽然近几年产...
前言 通过学习前面几个模块,我们已经发现了基于多组学数据找出的乳腺癌各亚型间具有非常显著的分子差异,而我们如果想深入挖掘其背后机制,就需要找出差...
说在前面 Immugent在之前一篇推文照葫芦画图之PCA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5O...
前言 近年来,随着免疫检查点抑制剂的兴起,大大改变了传统的肿瘤治疗策略,尽管 PD-L1 和 dMMR 的检测都获得了 FDA 的批准,提高了免...
前言 在介绍完 TCGAbiolinks 的查询下载和数据分析功能之后,我们简单展示几个示例,来练练手,加深对这个包的理解和使用 我们主要从: ...
参考: 批量下载SRR数据从NCBI-SRA和EBI-ENA数据库下载数据 最近下载了一些比较大数据,自己感觉下载公共数据,最快的方法用ascp...
首先,简单介绍一下新抗原(neoantigen)的含义,它是肿瘤细胞特异性表达而正常细胞(除了睾丸之外)的一种抗原性多肽, 它能被免疫系统的T细...
专题公告
TCGA数据分析