作者，Evil Genius 单细胞分析流程 今日的参考文章在Integrative spatial analysis reveals a multi-layered org...
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空间多组学分析显示胶质母细胞瘤具有多层结构 -
系统比较Seurat和scanpy版本之间、软件之间的分析差异作者，Evil Genius 标准的单细胞rna测序分析(scRNA-seq)工作流程软件括通过序列排列将原始读取数据转换为细胞基因计数矩阵，然后进行过滤、高变量基因选择、降...
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10Xvisium HD高精度平台探索作者，Evil Genius 看到最近的反馈，大家似乎对相亲的事情很感兴趣啊，😄，但是大家别光顾笑啊，女孩子想想自己30多岁会不会也是这样，男孩子30多了想想遇到这样的女人该...
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空间转录组识别恶性-边界-非恶性轴肿瘤空间微环境解析2作者，Evil Genius 今天我们一群光棍们在吃烧烤，有个光棍问，100斤鸡蛋重还是100斤女人重？一下子大家都笑了。 今天我们继续补充关于肿瘤边界划分的分析，文章在Re...
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空间数据库SpatialTME与空间主要分析作者，Evil Genius 在昨天的文章空间转录组识别恶性-边界-非恶性轴肿瘤空间微环境解析[https://www.jianshu.com/p/e5ec1eede5c9]...
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空间转录组识别恶性-边界-非恶性轴肿瘤空间微环境解析作者，Evil Genius 科研进展 2023年02月20日，上海交通大学医学院上海市免疫学研究所叶幼琼研究员团队在Nature Communications 上发表题为“...
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单细胞空间联合分析之SpatialScope作者，Evil Genius 今天有人问我，HD的出现是否会取代visium,我个人觉得短期不会，visium和HD会并行存在很长时间，现有的visium数据也也很大部分没有...
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空间细胞共定位与空间邻域通讯分数脚本更新（python版本）作者，Evil Genius 大家好，欢迎来到太原废柴相亲记，周五相亲的91年大姐今天下午3点多突然给我发消息，说他弟弟结婚，问我能不能拿出10万帮他弟弟凑个房子的首付，10...
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单细胞空间突变信息分析导论作者，Evil Genius 想想自己真的挺搞笑的，读大学的时候觉得27、28怎么着也结婚了吧，没想到混到30多去相亲了，喜欢的女孩子无一例外都把自己给踹了，😄，相亲么，说真...
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空间邻域分析导论（CellNeighborEX）作者，Evil Genius 我们来做一篇导论，关于空间邻域 空间邻域分析包括分子邻域和细胞邻域，分子邻域主要研究邻域通讯，细胞邻域主要研究生态位，我已经分享了很多了，做一篇...
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嚼槟榔下的空间转录+代谢景观改变作者，Evil Gneius 槟榔大家熟悉吗？ 嚼槟榔是一种在我国台湾[https://baike.baidu.com/item/%E5%8F%B0%E6%B9%BE/122...
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空转数据分析之特异性生态位基因依赖的细胞通讯作者，Evil Genius 周二了，又是催相亲的一天，大概率又要见一个奇葩女。 空间的邻域通讯汇总过了，文章在空间邻域通讯分析大汇总[https://www.jianshu...
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空间邻域通讯分析大汇总作者，Evil Genius 今天我们来汇总一下所有的关于空间邻域通讯的分析方法，供大家参考。 分析方法包括单细胞的改良版cellphoneDB、CellChat、Niche...
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空间转录组niche通路富集与空间“hotspot”作者，Evil Genius 随着空间转录组的技术发展，我们需要更新和扩展非常多的内容，而且随着空间通量的提高，很多都要转到python版本运行了，而且python版本也更新...
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空间转录组数据分析之niche“环”（ring）作者，Evil Genius 不知道大家发现了没有，自然界对圆情有独钟，三维上就是球，从原子到地球、太阳，都离不开圆和球。 即使放在我们空间转录组而言，最开始的Visium也...
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空间转录组分析之细胞Niche（python）版本作者，Evil Genius 其实关于细胞niche，之前已经分享了R版本的代码了，内容在 10X空间转录组数据分析之细胞niche[https://www.jianshu....
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空间转录组细胞niche、细胞频率、通路niche、空间互作、空间hotspot全系列脚本更新（python版本）作者，Evil Genius 清明了，最近一直在相亲，每周都会见一个女人，注意，是女人，不是女孩子，因为大家都30多岁了，或者快30岁了，法定16岁就是妇女了，不得不说真的被...