fastp去umi测试 在二代测序中,由于文库的质量偏低,通常需要增加umi以标记reads序列常规有使用一下两个方法进行去umi: 方法一:使用-U的命令 fastp -i...
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一、进入https://anaconda.org/ 查看,如果有,那就太方便啦!picard 就是有的!害,我白忙活了一下午 conda install -c biocond...
介绍 安装 1.下载homer文件 网址:http://homer.ucsd.edu/homer/download.html 下载其中名为configureHomer.pl的...
到了年根了,其实想总结一些之前的东西,其中cell2location很想再次分享一下,好好研读一下。 Cell2location 是一种有principled Bayesia...
一、 基本介绍 Trim Galore是对FastQC和Cutadapt的包装。适用于所有高通量测序,包括RRBS (Reduced Representation Bisu...
玩转单细胞(2):Seurat批量做图修饰[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid=2247486164&i...
AnnData是python中存储单细胞数据的一种格式 1. AnnData数据结构: 主要包含四个slots:X contains the expression matri...
直接上一个例子 如果有大括号,就用两个, 制表符需要用两个斜杠\\t换行符\n也是这样 单引号和双引号 正常写就行
0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控:fastp[https://git...