@1_2a9d ,这种的我还没试过,方便发一个测试一下吗?2018060369@nwafu.edu.cn
R package:xcms(一):导入数据导入所需要的包 1.单个样本 导入 提取基峰色谱图 2.多组数据 导入 提取基峰色谱图 参考资料: LCMS data preprocessing and analysis ...
@1_2a9d ,这种的我还没试过,方便发一个测试一下吗?2018060369@nwafu.edu.cn
R package:xcms(一):导入数据导入所需要的包 1.单个样本 导入 提取基峰色谱图 2.多组数据 导入 提取基峰色谱图 参考资料: LCMS data preprocessing and analysis ...
导入一段DNA序列 设置窗口碱基的长度 计算GC含量 计算AT含量 可视化
faahko <- fillChromPeaks(faahko, param = ChromPeakAreaParam()) featureValues(faahko, va...
如果我们想查看KEGG通路图,可以把kegg对应的通路保存为R脚本。点击命令行就可以打开。 还可以将上下调基因对应名称标红或标绿
参考资料: https://mp.weixin.qq.com/s/zCiZVxYR0HsglMVgJt9yNQ[https://mp.weixin.qq.com/s/zCiZ...
@美味蟹黄堡_6165 报错提示信息是什么?
Python:将fastq文件转为fasta文件fastq格式如下: 第一行是序列标识(read ID)以及相关的描述信息,以“@” 开头;第二行即为碱基序列,长度由测序策略决定;如SE50第三行以“+”开头,后面是序列标...
关键在于参数outlier.alpha,将其设置为数值“0”就可以了,只是隐藏并未去除。
柱子正中间那个点为boxplot画的离群值
为啥呢老会多一个点?,而且每次让让ggplot重新出,这两个点的距离还会变,求解,真的一直困惑着我
主要用的是macs2包的子命令callpeak 参数说明: (1) -t : t是treatment组的意思,意为实验组,如果有多个样本,可以写为 -t A B C。(2) ...
下载芯片注释文件 合并表达矩阵 将探针注释矩阵ids按差异基因data1行名排序,然后合并 筛选差异基因 保存结果
样本分组 差异分析 step1 使用LmFit函数进行非线性最小二乘分析 step2 使用经验贝叶斯对t-test中方差部分进行调整 step3 得到差异表达分析结果 合并表...
提取表达矩阵 如果是getGEO函数导入的,exprs函数提取表达矩阵 如果是read_tsv函数导入 查看数据分布 对数值进行log2转换 查看数值分布
getGEO是GEOquery包从网络下载GEO数据并导入R的一个函数,正因为依赖于网络原因,经常会遇到下载失败的情况,尤其是下载样品较多的数据集。所以优先推荐直接在官网上下...
GEOquery是从网络下载GEO数据并导入R的一个包。官方推荐的安装方法: 网速太差,多次尝试都中断了,最后以失败告终。于是官网下载源码,RStudio安装,出奇快,30s...
做过scRNA-seq的都知道,Seurat包中有一个PercentageFeatureSet函数可以计算每个细胞中比对到线粒体的UMI/read Count比率。如果把组织...