最近一直在学习单细胞方面的知识,无意中看到别人的帖子在分享如何画堆叠的小提琴图(StackedVlnPlot),顺便就学习了一下。发现Sta...
目前,虽然单细胞测序技术允许在一次实验中进行成千上万个细胞的转录分析,但一直存在数据稀疏性的问题,如基因的覆盖度低,Dropout等。这些现...
最近需要处理10x Visium空间转录组的数据,所以到官网学习了一番基础分析流程的内容。 Slide Parameters 需要搞清楚数据使用...
特定版本下载链接:https://googlechromelabs.github.io/chrome-for-testing/files[htt...
基因的可变剪切造就了转录本的多样性,作为一种常见的基因表达调控机制,对于生物体的生长、发育和适应环境等方面都具有重要作用。前面写过一篇关于b...
目 标 单细胞分析目的和数据特征决定了分析的策略,数据分析选择高变基因而不是使用全部基因,为了达到以下几个主要目标: 提高信噪比单细胞数据中...
基因的可变剪切造就了转录本的多样性,作为一种常见的基因表达调控机制,对于生物体的生长、发育和适应环境等方面都具有重要作用: 增加基因编码的多...
常见组蛋白修饰的ChIP-seq数据,使用macs2分析时会面临一个问题,peak的峰形到底是narrowPeak还是broadPeak?基...
STAR从version2.7开始支持对scRNA-seq的定量,随着版本的升级,从一开始只支持Droplet类型到现在可以涵盖几乎所有类型...