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    GO富集之topGO

    topGO手册中的实例实现 手册地址:http://bioconductor.uib.no/2.7/bioc/vignettes/topGO/i...

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    R语言调色

    R中的颜色 R提供了657个颜色名字,还有rbg()函数来自定义颜色,在cairo_pdf中还支持透明度调节 R提供了许多调色板,可以查看默认调...

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    MA plot

    MA plot MA plot即M-versus-A plot,在芯片数据处理出现之前也称为Bland-Altman plot,是由发明者名字命...

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    芯片数据的标准化方法(2002年文献)

    感觉芯片分析很多原理不是很懂,2002年的这篇文献介绍标准化思想在RNA-seq和芯片分析中都得到了广泛应用,其中并不涉及复杂的统计学公式,读完...

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    Lecture 7 Affymetrix,R与bioconductor(芯片数据预处理及质量控制)

    原笔记地址:http://x2yline.gitee.io/microarray_data_analysis_note/ 1. 芯片数据结构 芯...

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    统计学第七章 卡方检验【R语言实现】

    知识点 卡方分布(Chi-square distribution) 四格表资料的卡方检验 配对四格表的卡方检验 四格表资料的Fisher确切概率...

  • 无重复RNAseq样本Gfold值的计算

    使用Gfold进行无重复RNAseq数据基因差异分析 1. 准备资料 输入的资料为read_count,要对两个样本进行差异分析则必需准备两个文...

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    R语言基础绘图之边距参数

    边距参数 Reference:https://www.r-bloggers.com/setting-graph-margins-in-r-usi...

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    第十九章 生存分析

    生存分析与cox回归