发简信
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使用Agora/ANGEs构建祖先核型0.忘了是在那篇文献看到的，用了Agora，再把Agora的输出结果喂给ANGEsAgora和ANGEs都是构建祖先核型的软件个人实测是Agor...
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保守loop的鉴定 - 三维基因组
通过三维基因组的分析鉴定了一些loop（染色质环）想看这些染色质环在物种间是不是保守的，或者做一个核心loop，类似于泛基因组 2.保守loop...
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自用笔记 - 基于同源预测和从头预测注释基因组上的目标基因
以一个物种为例, 多个物种批量生成命令行即可 一个物种，5个CPU的运行时间，限速步骤在第一次GeMoMa：real 3m44.931su...
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使用juicer进行三维基因组分析1.输入文件的准备创建一个文件夹，以物种名命名，比如:mkdir spalax_galili 在spalax_galili文件夹中再创建2个文件...
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对目标基因进行注释 - 基于同源注释和从头注释
该流程尚未完成 需求是想在一大堆基因组中鉴定目标基因比如叫 EPAS1 最简单的肯定是基于已有的结构注释的结果，进行功能注释，看能不能注释到EP...
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两个绘制韦恩图的网站
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/ [http://bioinformatics...
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仅作个人笔记 - 早期基因流的fastsimcoal2模型的配置文件仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂 只谈两个群体 配置文件来自于fsc论坛https://groups.google.com/g/fas...
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仅作个人笔记 - 单基因家族分析仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂 参考https://www.jianshu.com/p/3822d736234c[https://w...
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跟着Science学保守元件(Conserved Elemtns)的鉴定0.代码来源文章参考:《Large-scale ruminant genome sequencing provides insights int...