简介 1. 物种丰富度指数(Species richness)：群落中丰度大于0的物种数之和，一般用Observed OTU(observed ...

简介 三元图(Ternary plot)1是描述三个变量之和为常数的质心图，其核心原理是： 等边三角形内任意一点到三角形三边的距离之和等于其中一...

简介 PCoA分析，即主坐标分析（principal co-ordinates analysis），是一种非约束性的数据降维分析方法，可用来研究...

codml 位点模型 (Site model) 假设蛋白质氨基酸序列或密码子序列中不同位点受到的选择压力不同，可以通过 model = 0和多个...

介绍 微生物多样性分析中，α多样性主要关注局域均匀生境下的物种数目 ，通俗来讲就是样本内的物种多样性。β多样性是指在地区尺度上，物种组成沿着某个...

简介 维恩图和UpSet图均可用于集合共有和特有元素信息可视化，如果分组数小于等于5时，推荐用维恩图进行展示；当分组数大于5时，推荐用Upset...

ggtern ，用于创建三元图的ggplot2的扩展包，详细参数和用法见 官方说明文档 。 三元图是可以绘制三种不同元素或化合物的混合成分的特征...

简介 曼哈顿图(Manhattan Plot)本质上是散点图，一般用于展示大量非零的波动数据，散点在y轴的高度突出其属性异于其他低点:最早应用于...