发简信
IP属地：西藏
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【宏基因组入门教程】（一）
最近接手了宏基因项目，会在之后接着发一系列的宏基因组入门教程，学习资料大概来自国外的教程。感谢Harriet Alexander, Phil B...
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通过Kmer分布评估基因组大小—————— 持续更新 关键词：Genome Size Estimation; Kmer 一.Kmer评估法简介 假如有一批二代或三代基因组测序...
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细菌全基因组测序数据构建SNP系统发育树
本次分析使用到的数据及数据处理流程参考文献“https://doi.org/10.1186/s13756-018-0352-y[https://...
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生物信息python 入门题 初级至进阶
本文水平有点low，本来不打算写这么低水平的文章，怎奈我的python水平就在这么low的水平。以此贴记录初试python解决生信简单问题的学习...
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wtdbg 组装基因组
关键词：pacbio; nanopore; assemble wtdbg相较于其他三代四代数据组装软件（Canu，smartdenovo，min...
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细菌基因组下载
最近需要尽可能的下载细菌基因组，ncbi ftp站点（ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes）里面"all"这个目...
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【基因组——天麻】天麻基因组揭露植物适应异养
Mycoheterotrophs（真菌异养型植物）：植物和真菌的共生大概开始于450百万年前。真菌异养是一种特殊的植物-真菌共生类型，植物从共生...
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原核生物基因组三代数据（pacbio/nanopore）组装
动物随随便便几个G，植物动不动十多个G，而细菌基因组一般就几M，基因组结构简单，没有重复序列杂合度这些组装障碍。我现在很多文章细菌基因组开始用三...
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基因组组装结果中去除细胞器序列
如果没有该基因组细胞器序列，需要先组装细胞器序列，再比对去除 如果有了该基因组的细胞器基因组（如公开数据库可获取），通过比对去除 细胞器基因组组...