Consensus Clustering(一致性聚类),无监督聚类方法,可根据不同组学数据集将样本区分成几个亚型,从而发现新的疾病亚型或者对不同亚型进行比较分析。 Conse...
Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X CreateSeuratObjecet质控 PercentageFea...
展信安,万万没想到,我还是选择带一个本科生班级(都柏林学院22园艺1班)。知道我的,或许都清楚,其实我并不喜欢别人喊我「老师」云云。与我而言,叫一声「老师」和一声「师兄」,是...
本文首发于公众号:医学和生信笔记 医学和生信笔记,专注R语言在临床医学中的使用,R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机...
小郭叨叨叨:上年发现运来兄有介绍桑基图,感觉好玩,但不知如何使用,无学习的欲望;最近发现果子大神也在介绍桑基图,又勾起了我的好奇心,偷闲学习了一下有关桑基图的R包,特此搬砖备...
本文是【专题“DeepLearning学习笔记”】的第【2】篇上一篇:【DL笔记1】Logistic回归:最基本的神经网络 一、神经网络中的编程指导原则 就一句话: 只要阔能...
个人认为理解并掌握这个logistic regression是学习神经网络和深度学习最重要的部分,也是最基础的部分,学完这个再去看浅层神经网络、深层神经网络,会发现后者就是l...
在生信分析或者一些其他的数据分析中,经常会需要绘制桑基图,在这里推荐一个非常nice的R包-sankeyD3(类似于networkD3,但是比其功能更加完善),其出的桑基图比...
EM(Expectation-Maximization)算法是一种常用的估计参数隐变量的利器,也称为“期望最大算法”,是数据挖掘的十大经典算法之一。EM算法主要应用于训练集样...
图1是冲积图,图2室桑吉图。 冲积图(Alluvial plot):(左右没有先后顺序,不存在箭头表示先后,左右的位置可以随意互换) 显示如何跨类别维度分配事实群体。 左/右...
引言 本期由来自哈工大的同样热爱科普的潮汐之子为我们带来t-SNE的全方位普及,作者的研究方向为自然语言处理。 说明 本文目的是做成一个60分钟t-SNE闪电入门简介,可能无...
跟着Nat Commun学作图 | Post-hoc图(Extended error bar plot) Ling N, Wang T, Kuzyakov Y. Rhizos...
GOplot | 更美观的富集分析可视化 数据准备 GOplot使用了zscore概念,但其并不是指Z-score标准化,而是指每个GO term下上调(logFC>0)基因...
LSTM(Long Short Term Memory Network)长短时记忆网络,是一种改进之后的循环神经网络,可以解决 RNN 无法处理长距离的依赖的问题,在时间序列...