Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段(短读 short reads)“覆盖”的强度有多大? 每一...
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI (National Cente...
annovar对人类基因组和非人类基因组variants注释流程 部分翻译自:Hui Y, Kai W. Genomic variant a...
前言 最近刚回来,发现实验室服务器各种bug,首先apt升级了一些软件,然后老版本的R 3.3.1升级到了3.6.1,于是乎出现以前安装的包不能...
前言 最近做的项目要对reference genome基于突变进行一些modify,制作personalized genome或者说是psued...
GATK GATK (全称The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute开发的用于二代重测序数据分析的...
WSL介绍 WSL(Windows Subsystem on Linux),适用于 Windows 的 Linux 子系统,是微软和Canoni...
主要是前段时间要从一个server上面拷贝一批数据,但是又不是linux,所以实验了一下windows下的批量拷贝; 场景: 测序的项目,每一个...
有时候会需要对大文件进行并行处理,但是perl中不像其他的语言,可以使用多线程,perl的多线程其实就是对文件进行切割; 而对于文本文件,...