发简信
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Seurat取子集时会用到的函数和方法在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理...
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快速计算基因表达软件：Salmon我们常见的转录组表达分析一般都是将reads比对至参考基因组或者转录组上，然后在基因或者转录本水平上定量表达丰度。 但最近在做小RNA分析时却遇...
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linux中安装Rstudio Server在linux服务器上使用R语言及Rstudio server 1. R 获取 官网：https://mirrors.tuna.tsinghua....
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Blast常用命令
构建蛋白质数据库： 构建核酸数据库： blastp 个人在使用blastn的过程中总结了一些自认为常用的参数，总结如下： 结果文件简写 含义 ...
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R语言中的管道符%>%
与linux中的管道符(|)功能相似，都可以进行数据信息的传递。 ％>％：来自dplyr包的管道函数，我们可以将其理解为车间里的流水线，经过前一...
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Cellranger count 中网页结果说明在cellrangercount运行结束后，outs文件夹中会有一个名为：web_summary.html的网页文件，可通过浏览器直观的查看测序...
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gather()和spread()函数，用于改变数据格式gather() 和 spread() 这两个函数在tidyr这个package里，是专门用来做数据清洗的函数. 例子：gather()是用来把...
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傻傻分不清的：归一化(normalization)和标准化(standardization)
一、常用的特征缩放算法有两种： 归一化(normalization)和标准化(standardization) 二、归一化（normalizat...
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单细胞中的标准化和PCA：哈佛生信课程学习（一）搬运自哈佛生物信息课程：《Introduction to Single-cell RNA-seq》链接：https://hbctraining....