发简信
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WGCNA(2):选择软阈值+网络构建来源：自动网络构建_Horvath_Lab逐步网络构建_Horvath_Lab 1准备阶段：加载包、数据集 2阈值选取 based on the...
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WGCNA(1)数据导入+去除异常值进行WGCNA要注意，WGCNA输入（INPUT）的是：行对应着一个样品，列对应着探针的矩阵或者数据框。 0 数据准备 从WGCNA教程网站上下...
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fRMA
前言 fRMA算法允许用户单独预处理数组，同时保留多阵列预处理方法（如RMA）的优点。基因表达Bar'code提供绝对表达的估计而不是相对表达。...
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R sort、rank、order、arrange排序函数
本文转载自：https://www.cnblogs.com/hider/p/10019536.html[https://www.cnblogs....
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基因注释--Genesymbol转化为EntrezID基因的命名有很多种，常见的有GeneSymbol、ENSEMBLID、EntrezID等，为了在不同的基因命名方式之间快速转换，使用OrgDb。...
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R将列表（list）转换成数据框/矩阵
淡水鱼写于2020/2/15 将列表转换成矩阵，接着由矩阵转换成数据框。Eg.a,b,c,d,e均是R中的变量。 1-要掌握matrix()函数...
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使用getGEO()下载GSEMatrix.txt
使用GEOquery::getGEO()下载GSEMatrix 其中， 参数destdir是指下载后的文件放在什么地方，默认状态下是放在当前的工...
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加权基因共表达网络
一些之前学习过程中的笔记 ========================================================== ...
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R语言中分割以点为分隔符的字符串
淡水鱼写于2020/2/16 想将数据框的一列分成多个列，比如，某一列中一个元素为22222.43，想将其根据小数点进行分隔，小数点分隔符号有点...