难道,这不像孔雀开屏吗? 写在前面 组学数据已经泛滥,但是信息的挖掘仍任重道远。顺手的工具,可以节省使用者尽可能多的时间,或者将看起来很复杂,很难以完成的事情,变得非常简单。...
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这个是有读者在B站给我的留言问到的问题 热图每隔三行分开一小段 怎么实现?我最开始的想法是用ggplot2来做,将数据拆分,每三行数据做一个图,最后采取拼图的方式来实现。 后...
两个dataframe数据之间的连接关系 经常会碰到需要把两个数据进行合并,大的方向有按“列”和按"行"合并两种方式,这里主要讲下按“列”进行合并,如下图,假设有a、b两个数...
写在前面:经常做转录组分析,就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选择,能直观比较各种处理带来的影响,如下: 来自Nature ...
上一篇已经系统介绍了有参RNASeq上游分析,从测序数据fastq文件到最终生成表达矩阵。这一系列基本都是RNASeq通用常规分析,其下游差异表达及可视化则根据需求及...
linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是一个Python下和Canop...
使用Gfold进行无重复RNAseq数据基因差异分析 1. 准备资料 输入的资料为read_count,要对两个样本进行差异分析则必需准备两个文件,每个文件格式如下: 文件1...
1)简介 edgeR作用对象是count文件,rows 代表基因,行代表文库,count代表的是比对到每个基因的reads数目。它主要关注的是差异表达分析,而不是定量基因表达...
用到GFOLD是因为我拿到了没有重复的样本,所以试试,第一次做,欢迎大家和我讨论参考文献是:GFOLD大部分安装参考这篇博客我也用到了CORNAS来分析,详见这篇我的CORN...
一、安装gfold Gfold软件是做没有生物学重复样本首选的软件https://zhanglab.tongji.edu.cn/softwares/GFOLD/index.h...
熊金波实验室出品 整理归纳:Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下: 地址:gs0.genek.tv 用户名:u3276 密码:genek.tv(建议...