IP属地：上海
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SV分析流程
一、原始数据比对到参考基因组 bwa ：Version: 0.7.17-r1188 picard ：v3.11 sortsam picard ：...
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二代测序：Phred33和Phred64格式判断
原理：取10000行，求平均碱基质量，来判断格式 很明显是phred33格式的
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群体杂交渐渗基因流软件基因型填充 - fillGenotype - beagle 基因型填充(Genotype-Imputation)：从原理到操作 - 知乎 (zh...
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slurm常用命令
slurm作业集群常用命令：常用Slurm作业投递及查询命令_怎么查看slurm单独作业使用cpu的情况_Xiaofei@IDO的博客-CSDN...
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call snp 建立索引
参考基因组索引：
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植物资源网站
基因组信息查询：首页 - 国家基因组科学数据中心 (cncb.ac.cn)[https://ngdc.cncb.ac.cn/]National ...
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SNP|vcf深度过滤
群体遗传分析中SNP过滤中通常有一步：保留1/3个体平均深度<位点深度<3倍个体平均深度的位点，所以写了个小脚本占个位，有需要方便复制粘贴。需要...