终于还是走到这一步,思来索去,我还是决定,直接「关闭」TBtools的「高速插件商店」。当然,这对应了两个事情: TBtools 插件商店中又少...
我一直印象BUSCO评估基因组使用augustus进行全基因组基因结构注释预测,然而似乎BUSCO从 version5 开始默认直接使用 met...
写在前面 比较基因组分析中,常常会使用基因点阵图来查看大体的基因组共线性情况。基于我个人的认知,点阵图可能有几个用处: 确定共线性区块有无和情况...
写在前面 终于到了这一天,我又捡起了七八年做群体分析的技能....只是那会我画图就用 ggplot2,而现在我只用「TBtools」。基于重测序...
写在前面 如果说在湿实验的主要研究方向上,我还有没太接触的,那么就是“跑大版胶”,开发分子标记。于是,这一块相关功能,我并没有太多想法开发。只是...
关键词:零基础;叶绿体基因组;神器;国人佳作;一键成环。软件官网:https://github.com/Kinggerm/GetOrganell...
写在前面 当我们关注某个基因时,在计划对其开始基因功能研究之前,往往需要先做「基因家族分析」,原因有几: 通过演化树分会初步判断基因可能功能; ...
写在前面 我知道IQ-tree已经有很长一段时间了。不过我一直并没有使用它。主要原因是,常用的快速构建ML树的软件是FastTree,如果要求准...
写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别...