2019年的最后一天了，跟大家一起读一读文献吧，基于公共数据库数据挖掘发表在 Cancer Immunology Research杂志上，作者单...
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胃癌免疫微环境-生信分析典范 -
折腾了许久才复现出的WGCNA图-GSE106292你值得拥有
前些天老大布置了WGCNA的作业：下载GSE106292 数据集的 Excel表格如何读入R里面，做出作者文章中那样的图，但是分组很复杂，需要去...
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【代谢组学】4.生物标志物分析概念 生物标志物，即传说中的biomarker，是一类可测量的，用来表征疾病状态的物质，通常用于表征： 疾病的状态（是否为某种疾病/某种亚型）；...
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三分文章思路-1
三分文章思路-1 这篇3分文章思路记录下来，其实前面没有展示生信的图图，但是文章introduction部分，描述了通过TCGA数据库TCGA_...
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富集分析后取基因
文章是：Identification of ankylosing spondylitis-associated genes by express...
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基因芯片 寻找探针所对应的基因ID最近在学习处理芯片数据，遇到一个问题就是芯片数据和基因ID之间的对应问题。不然感觉自己做出的东西没有办法分析。 先来看一下芯片探针与基因直接...
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SNP，SNV 傻傻分不清楚？体细胞突变（somatic mutations） 我们的体细胞时刻在发生着变异，但是一般突变率都很低，并且细胞会进行修复，不能修复就被免疫系统破...
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TCGA数据库-肿瘤基因组图谱
参考来源：生信菜鸟团 一、简介 肿瘤基因组图谱 (The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划由美国 National Can...
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R 如何实现更快读取数据 - 使用readr包
Hadley Wickham 和 RStudio 团队开发了一个新的用于文本数据读取的包，那就是readr包。readr包提供了几个新的函数，能...
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CHETAH: sc-RNA-seq 细胞类型定义工具细胞类型识别对于单细胞RNA测序(scRNA-seq)研究至关重要，目前正改变着生命科学。CHETAH(分级分类辅助的细胞类型表征,CHarac...
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