tags： RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比对 对 RNA-seq 产出的数据进行变异检测分析，与...

这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在这里，教程条理清晰，对我理解芯片数据分析流程...

tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效...

tags： NGS duplication 不管从哪个角度看我们都希望测序仪产出的数据中 duplicate 率尽量低。怎样降低 duplica...

tags： HISAT2 RNA-seq HISAT2 发表的文章中强调了它的速度很快，我就测试了一下这个工具。 HISAT2 建立索引： 然而...

为了解决自动化报告之类的问题，测试了几种不同的方案之后，我选了 LaTex。利用 LaTex 生成 PDF 文档可定制性强，排版精美，虽然不像 ...

测序数据比对结果 BAM 文件用 samtools 进行 sort 之后发现体积变小了...当时怀疑是不是 sort 过程中有一部分 reads...

向量是 R 最基本的变量 R 中变量的类型称为模式。 R 中最基本的变量类型是向量，一维的向量，没有标量，任何一个看似标量的变量其实都是长度为 ...

当一个 NGS 项目中对同一个样本进行了 WGS 和 RNA-seq 测序，或者对同一个肿瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织同时进行 WGS / WES...