介绍 使用ggplot2的主成分双标图 代码 加载R包和数据 画图
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@定阅号 是的,要看你研究的目的,因为PredProb的两列是分别对两组进行概率预测的。roc在给点不同的预测概率后得到的结果可能不同,这个时候会修改positive和negative的分组属性。因此在最开始设置分类标签分组的时候,就需要确认到底哪一个是positive哪一个是negative。详细可参考这里 https://blog.csdn.net/xifenglie123321/article/details/136927417
数据分析:随机森林random forest在二分类中的应用介绍 随机森林是常用的非线性用于构建分类器的算法,它是由数目众多的弱决策树构建成森林进而对结果进行投票判断标签的方法。 随机森林用于分类器的算法过程, 随机切分样本,然后选择...
@定阅号 您好,在构建模型的时候,先要确定自己的positive分组时候什么。因为在计算ROC的时候是根据分类器的灵敏度和特异度来做的,它们分布针对positive和negative分组的。有的模型对positive识别能力很强,但是对negative识别能力则很弱,这些信息都可以通过confusion matrix查看到的。就比如,疾病分类模型中,对把疾病(positive)错判成正常(False positive)是容忍度很低的,有时候宁愿正常(negative)判断成疾病(false positive),因为后期可以细致检查就可以发现是错判的。AUC是对上述两种能力的一个综合评估,一般分析是要求提供precision, specificity,sensitivity和recall,有的甚至需要PPV等指标。
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前沿 今天阅读一篇文章看到 "Two-sided Wilcoxon tests blocked for ‘study’",以前经常见过ANOVA有分区的计算,但是也是第一次见...
@8dc3a81e8118 https://zouhua.top/DraftNotes/index.html 在这里的代谢组分析部分
数据分析:从样本制备到MaxQuant搜库前言 LC-MS/MS Liquid Chromatography-Mass Spectrometry(LC-MS/MS ,液相色谱-质谱串联)可用于残留化合物检测、有机小分...
@早_ad1b 您好啊,FC一般是对raw data做,因为它本身不涉及到正态分布等问题,详细可参考我这里的教程哈。https://zouhua.top/DraftNotes/%E4%BB%A3%E8%B0%A2%E7%BB%84%E5%B7%AE%E5%BC%82%E5%88%86%E6%9E%90.html
数据分析:质谱数据预处理前言 在使用MaxQuant软件处理Raw mass spectrometry data后,对输出结果“proteinGroup.txt”做数据过滤处理,得到可用于下游数据分...
@早_ad1b 不好意思,换了电脑,数据暂时找不到。你可以参考我这里 https://zouhua.top/DraftNotes/%E4%BB%A3%E8%B0%A2%E7%BB%84%E6%95%B0%E6%8D%AE%E9%A2%84%E5%A4%84%E7%90%86.html
数据分析:质谱数据预处理前言 在使用MaxQuant软件处理Raw mass spectrometry data后,对输出结果“proteinGroup.txt”做数据过滤处理,得到可用于下游数据分...
在做单细胞分析时,无论是用monocle3还是2,都会出现各种各样的问题,记录一下解决过程 monocle3: 问题1 在用 和 时,会遇到和 leiden相关的问题。 解决...
谢谢你,已经更正
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