1.Sam文件各标签含义(tophat/hisat2) NH:i:<n style="box-sizing: border-box;">: N=1时 为unique。常用于t...
1.Sam文件各标签含义(tophat/hisat2) NH:i:<n style="box-sizing: border-box;">: N=1时 为unique。常用于t...
原始来源,仅供备忘:https://xizhihui.github.io/2018/10/14/%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%8F%98%E5...
这是进行任何网络分析的第一步。我们在这里展示如何加载典型的表达数据,将其预处理成适用于网络分析的格式,并通过删除明显的异常样本和基因来清理数据。 Data Input[htt...
因为课题需要,我们在前期组装了一个基因组并进行了注释,但是存在两个问题,一个是没有考虑可变剪切,另一个是注释的基因并不准确,三代转录组的广泛普及对于基因研究提供了很大的便利,...
因为花生有20条染色体,“tab20”可能比较合适,也可以其他配色自己调整 可以截取一部分进行使用,比如截取前四个: 如下图所示: 也可以基于此进行重复使用 采用前六个并且重...
由于bam文件是二进制的压缩文件,正常情况下我们无法用普通编辑器打开查看,一般情况下我们借助samtools软件来对文件进行处理。但很多小伙伴一定遇到过这样的问题:如果我想对...
目录 一,linux子系统安装(Ubuntu20.04) 1,配置安装环境 2,下载Linux的Ubuntu系统 二,Linux迁移到D盘 1,通过github下载迁移程序L...
目录 前记1、下载和安装2、使用介绍2.1、绘制简单的遗传图谱2.2、绘制带格式的遗传图谱2.2.1、对连锁群名称的注释2.2.2、对分子标记的注释2.2.3、设置背景板样式...
samtools过滤多重比对reads samtools[https://www.omicsclass.com/topic/283] samtools过滤多重比对reads ...
转载自-诺禾致源-知乎 从提出人类基因组计划发展至今,已经超过了20年。目前,一个物种参考基因组的构建,往往是选取一个样本,以线性排列的方式进行呈现,但单个个体遗传信息是具有...
NAME samtools markdup – mark duplicate alignments in a coordinate sorted file SYNOPSIS ...
格式转换 hapmap格式:hmp.txt plink格式:ped和map以及二进制文件bed/bim/fam vcf格式:vcf 1.1. hapmap <-> vcf #...
vcf文件的全称是variant call file,即突变识别文件,它是基因组工作流程中产生的一种文件,保存的是基因组上的突变信息。通过对vcf文件进行分析,可以得到个体的...
Windows下首先需要找到.condarc文件如果你不知道在哪的话可以这样win+R输入%HOMEPATH% 然后找到.condarc文件 把里面的内容替换成下面的 con...