发简信
IP属地：上海
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转录组分析中的免疫浸润的评估方法注：本文仅讨论转录组数据中的免疫浸润评估。关于免疫浸润的计算，其实有不少综述进行过总结。笔者看到过2篇发表于2018年的相关综述（虽然现在都20...
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生信知识补充目前研究转录组的方法主要三种：（1）基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片；（2）基于sanger测序法的SAGE (serial anal...
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文献阅读专题
第1篇 原文：Integrative analysis of gene expression and DNA methylation throu...
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跳出套路的生信分析第1篇 原文：High-dimensional single-cell analysis predicts response to anti-P...
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常用模型使用简介
XGBoost xgboost入门与实战（原理篇）的后半部分介绍了需要注意的参数和基本使用方法。神器xgboost简单入门和运用手把手教写出XG...
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非编码RNA生信分析第1篇 发在Journal of Translational Medicine（4分）。原文：Circular RNA regulatory n...
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甲基化套路和甲基化有关的。可以先了解下甲基化：450k甲基化基础450K甲基化芯片数据处理传送门450k甲基化芯片常用工具包：ChAMP和minfi等。 ...
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生信数据库
最常使用的数据库是TCGA和GEO，网上有一些不错的博客介绍了如何使用这两个数据库，本文不再赘述，直接贴链接吧。 TCGA数据库：TCGA-GD...
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转录组学数据挖掘基本方法本文初步记录了下转录组数据挖掘的基本工具使用方法，之后将补充各个工具的官方文档说明。 转录组学数据挖掘基本套路 1-差异分析套路路线。先跑出差异...