学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
IP属地：吉林
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Juicer:Hi-C数据处理分析（一）参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
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@热爱大自然的小和尚 感谢感谢！！
生信学习笔记：使用SNP data做基因渗入分析 (4)
继续上一周的内容，上次讲到了如何使用--tree Dsuite的功能。要使用--treeDsuite的功能，我们显然需要一个树文件。一般树文件可以通过SNP数据画取进化树来获...
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@番茄_9493 你安装LD-deca那里有呀
LD衰减图的理解与应用
在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
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Mash: 使用MinHash快速估算基因距离
工具介绍 Mash扩展了MinHash降维技术，使其成对的突变距离和P值显着性检验，从而可以有效地聚类和搜索大量序列集合。混搭将大序列和序列集还原为较小的代表性草图，进而可以...
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科研文章发表的成功要素
由于临近博士毕业，没有再进行更多的生信技能的学习，主要精力都是放在文章发表，毕业论文写作方面。今天的推文继续和大家分享一篇非常好的文章“What makes a plant ...
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有效读文献的十大简单规则
读文献是每个科研工作者的必修课。无论你是科研小白，你需要通过读文献来入门你所感兴趣的领域。又或者你是学有所成领域内的专家，也要通过读文献来了解领域内的最新发现来修炼内功，扩充...
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@不整点没灵感 我不太了解哦这方面。我知道的是如果你数据缺失比较多是需要的
群体遗传学习笔记-基因型缺失数据的填充
Genotype Imputation是在高通量测序中常出现的定义，按照义译就是基因型填充。要真正理解imputation这个概念，我们就需要先理解基因型缺失（genotyp...
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@我们一起舔过铁栏杆 10乘的测序深度
群体遗传学习笔记-基因型缺失数据的填充
Genotype Imputation是在高通量测序中常出现的定义，按照义译就是基因型填充。要真正理解imputation这个概念，我们就需要先理解基因型缺失（genotyp...
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@13618622625 简书把github的图屏蔽了，我没有重新做床，你可以去github网上去看看
变异vcf文件可视化神器
今天给大家带来一款非常方便好用的SNP变异vcf文件可视化神器:VariantQC。听到这个名字有没有似曾相识的感觉，嘿嘿嘿。没错，那就是FastqC了。相信大家对这个软件肯...
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群体遗传学习笔记：NGS结构变异检测原理
随着测序的成本越来越低，测序技术越发先进，除了研究单核苷酸多态性(SNP)。研究者们开始慢慢将目光转向了各位复杂，但是也同样非常常见的结构变异(SV)。接下来几期推文会和大家...
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【帕西诺独白】自律|成长|搞钱
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never stop playing
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是的是的，打错了。我来改一改
谢谢提醒LD衰减图的理解与应用
在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
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是的是的，打错了。我来改一改
LD衰减图的理解与应用
在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
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dplyr-cli：在Linux Terminal上直接执行dplyr
熟悉R的朋友都会知道，dplyr包是对原始的数据集进行清洗、整理以及变换的有力武器之一。但是其使用会局限于你需要有打开R/R studio或者通过R脚本来执行dplyr。对于...
个人介绍
西澳大学生物信息博士一枚
研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘
简信不回答问题，有问题发至
lakeseafly50@gmail.com
研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘
简信不回答问题，有问题发至
lakeseafly50@gmail.com