240 发简信
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  • 互帮互助问答帖

    虽然没有几个关注,但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到,我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等,如果...

  • awk 从一串字符中提取特定部分

    Parent=Os01t0115700-00 从这个字符中提取 Os01t0115700 echo "Parent=Os01t01...

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    基于 RepeatModeler 预测基因组的重复序列

    重复序列在基因组中广泛存在,包括转座子、简单重复序列和低复杂度区域等。这些重复序列对于基因组结构、功能和进化具有重要影响。RepeatModel...

  • 转座子元件注释 RepeatMasker 安装

    RepeatMasker是一个用于识别和屏蔽(mask)基因组中重复序列的软件工具。重复序列在基因组中占据了很大的比例,并且对基因组的结构和功能...

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    结构变异检测软件 SYRI 的使用

    目前检测结构变异的方法众多,长 reads 序列的比对有 NGMLR、Minimap2、Nucmer 等;基于序列比对结构检测结构变异的软件有 ...

  • 群体遗传结构分析(admixture、PCA、NJ_tree)

    首先,对 vcf 文件的格式进行转换,转换为 plink 格式: vcftools --gzvcf test.vcf.gz --plink ...

  • Inparanoid 寻找物种间直系同源基因

    InParanoid 是一个用于寻找直系同源基因(Orthologs)的计算机程序,其目标是发现不同物种之间具有相似功能的基因。 软件下载安装:...

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    R语言 ggplot2 柱形图添加误差条和差异显著性标识

    绘制分组柱状图;柱状图上添加误差线;组内柱子之间添加显著性差异表示(字母表示)。 大概思路是首先绘制分组柱形图,然后利用geom_errorba...

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    fastME 安装

    之前安装的 fastME 在使用的时候,发现有报错: fastme: /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.14...

个人介绍
张红祥,中国科学院植物研究所。
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