面面的徐爷 - 简书

RNA-seq数据分析---方法学文章的实战练习
前言这次给大家带来的是16年发表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇处理RNA-seq数据的文章：Transcript-level e...

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R语言里面的Principal Component Methods(PCA)主成分分析
Principal component analysis (PCA) 是一个统计学方法，用一组较少的不相关的变量代替大量相关变量，同时尽可能保留...

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Circos手把手极简入门（Windows篇）
Circos是数据展示的一个极佳方式。是每一个男人都应该学会的必备技能！如果按照我这个教程都搞不定的话，还是建议先别看别人的高阶教程了。 Ci...

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DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对
前言因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fast...

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DNA甲基化测序数据处理（二）：差异分析
前言衔接上一篇数据比对后的结果，使用R包DSS进行处理。 Input文件准备我们先来复习一下上一节课得到的数据结果：*.bismark.co...

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高通量测序数据处理学习记录（三）：Pathway Analysis及GSEA
Pathway Analysis讨论及基因富集分析软件（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）使用实战在所有物是...

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高通量测序数据处理学习记录（零）：NGS分析如何选择合适的参考基因组和注释文件
前言现有比对工具在做mapping之前，都需要下载对应物种的参考基因组做index，而如何选择合适的参考基因组是一件非常重要的事情。现有的参...

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高通量测序数据处理学习记录（一）：比对软件STAR的使用
high-throughput seq analysis急先锋——STAR的使用介绍在所有物是人非的景色里，我最中意你。正体这次给大家带来...

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ANNOVAR的使用
ANNOVAR的安装 ANNOVAR网址 log in之后才能download，使用教育机构后缀的邮箱即可注册。该测序是用perl语言写的，所...

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