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DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fast...
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Scale和Normalization的异同前言 在处理数据的时候，经常会遇到两个名词Scale和Normalization，这两个名词经常会被混杂着使用，让我在理解一些操作的时候经常会迷...
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DNA甲基化测序数据处理（二）：差异分析前言 衔接上一篇数据比对后的结果，使用R包DSS进行处理。 Input文件准备 我们先来复习一下上一节课得到的数据结果：*.bismark.co...
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处理conda安装工具的动态库问题——解决记录问题记录 在conda的某工作环境下使用rmats2rmats2sashimiplot作图的时候，发现有一个报错：无法找到libcrypto.s...
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R语言升级到3.6.0后遇到的Bioconductor安装问题
前言 目前R 3.6.1 都已经preRelease了，我笔记本上的电脑也赶忙把R从3.5.4升级到3.6.0（当然生产力相关环境还没敢乱升级，...
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RNA-seq数据分析---方法学文章的实战练习前言 这次给大家带来的是16年发表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇处理RNA-seq数据的文章：Transcript-level e...
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高通量测序数据处理学习记录（四）：DeepTools学习笔记
前言 开题啦，所以需要整合自己之前处理过的数据包括可视化作图，在GALAXY上翻到DeepTools正好有着一点用处，适当的搞了一波事情，顺带记...
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MACS2学习笔记
安装默认使用Conda macs2的基本命令 输出文件包括 为了方便在IGV上查看ChIP-seq的结果和后期的可视化展示，所以我们需要把mac...
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gfold问题处理记录
这次在新的服务器上安装gfold的时候，偶然发现GFOLD的官网已经404了，于是索性就conda一套进行安装conda install -c ...