发简信
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复旦大学和广东省人民医院的肺癌队列比较
我注意到2019年，有两个肺癌队列多组学发布，挺有意思的。其实肺癌一直是全球发病率最高的癌症，而 2020 年最新数据显示，乳腺癌新增人数达 2...
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对象何必到处乱找，自己创造即可
以下代码需要加载 GSEABase 包： 读取gmt文件看看GeneSetCollection 对象 自己去下载 h.all.v7.2.symb...
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对单细胞表达矩阵做gsea分析gsea分析这方面教程我在《生信技能树》公众号写了不少了，不管是芯片还是测序的表达矩阵，都是一样的，把基因排序即可。那在单细胞分析里面也是如此，...
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当然可以自己造轮子
前些天关于小学生寒假作业思考题的推文引发大量的讨论，见：连小学生都开始学编程了[https://mp.weixin.qq.com/s/t9mRs...
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RT-PCR表达量数据也可以差异分析最近搜集整理单细胞研究的时候，看到于2015年发表在nature杂志的文章是： Single-cell analysis reveals a s...
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带着文件夹结构的拷贝
最近接了一个单细胞转录组项目，有80个10X样品，每个样品的单细胞测序数据都是100G左右的fq.gz文件，很不容易跑完了全部的cellrang...
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cytofWorkflow之聚类分群（四）
前面我们公布了《cytof数据资源介绍（文末有交流群）[https://mp.weixin.qq.com/s/uJdLehEMah1uG5m58...
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cytofWorkflow之基本质量控制（三）
前面我们公布了《cytof数据资源介绍（文末有交流群）[https://mp.weixin.qq.com/s/uJdLehEMah1uG5m58...
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cytofWorkflow之构建SingleCellExperiment对象（二）
前面我们公布了《cytof数据资源介绍（文末有交流群）[https://mp.weixin.qq.com/s/uJdLehEMah1uG5m58...