Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是扩增子...
介绍 做完转录组分析之后,一般都要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。荧光定量PCR是一种相对表达定量的方法,他的计算方法...
多个图形合并在同一面板 文献主图一般是由多个子图构成,我们通常会使用Adobe illustrator软件拼接子图,但现在R提供了多种拼接子图方...
RNA-seq数据的批次校正方法 bulk-RNA seq过程可能存在不同建库批次以及不同测序深度带来的如测序深度等batch effects,...
在进行组间比较的适合,我们常常会使用Venn图展示,常用的Venn R包有gplots、venneuler、VennDiagram等,但是都不怎...
介绍 DESeq2常用于识别差异基因,它主要使用了标准化因子标准化数据,再根据广义线性模型判别组间差异(组间残差是否显著判断)。在获取差异基因结...
前言 LC-MS/MS Liquid Chromatography-Mass Spectrometry(LC-MS/MS ,液相色谱-质谱串联)...
介绍 clustlasso是结合lasso和cluster-lasso策略的R包,并发表在Interpreting k-mer based si...
前言 差异分析是转录组数据分析的必备技能之一,但众多的转录组分析R包DESeq2,limma和edgeR让我们存在选择问题,到底它们之间的优劣如...