大佬,能不能请教从基因组.pep的文件中,提取所有基因的各自的最长转录本的实操?
用Python提取FASTA中最长转录本在对拼装或者数据库下载的序列文件进行下一步分析时,我们通常会对序列进行去冗余操作,其中经常需要提取同一个‘gene’的最长转录本,所以动手用python写一个脚本。 一、基本...
大佬,能不能请教从基因组.pep的文件中,提取所有基因的各自的最长转录本的实操?
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一、OrthoFinder的安装 使用之前记得查看帮助文档: 二、OrthoFinder的使用OrthoFinder需要蛋白编码的Fasta(fa)文件作为输入,所以首先我们...
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有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
我觉得,找最新的 TBtools 群,不难啊 写在前面 如果我没有记错,那么标题 Warn my respect, earn it ! 应该是一部电影或是电视剧,一个不起眼配...
您好,可否请教您图C的横轴density和纵轴Ks的表示意义做下解读呢?谢谢!
使用wgd进行全基因组复制分析这篇教程是我在2019年9月左右分析WGD时的笔记。目前来看,背景介绍和软件使用说明都基本没啥问题。但是现在更建议大家使用wgdi进行比较基因组学中相关分析,教程见如何用WG...
这篇教程是我在2019年9月左右分析WGD时的笔记。目前来看,背景介绍和软件使用说明都基本没啥问题。但是现在更建议大家使用wgdi进行比较基因组学中相关分析,教程见如何用WG...
哦哦,谢谢作者的回复,我再去查阅这部分的内容,感谢!
WGD(全基因组复制)分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv(四倍简并位点颠换率)的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
小白可不可以请教一个问题,最下面图中纵轴密度和横轴Ks的具体意义是啥?如果您有时间可否解疑一下,
WGD(全基因组复制)分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv(四倍简并位点颠换率)的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...