240 发简信
IP属地:北京
  • RDKit|在PostgreSQL中进行分子相似性搜索

    文章目录 一、分子指纹计算二、相似性搜索三、自定义搜索函数 一、分子指纹计算 本文介绍在windows环境下,使用rdkit函数在postgre...

  • RDKit|在PostgreSQL中进行分子结构搜索与查询

    文章目录一、环境搭建二、数据表准备三、结构搜索与查询 1.smiles子结构搜索 2.smarts子结构搜索 3.立体信息的结构搜索 4.带取代...

  • RDKit|支持RDKit的PostgreSQL环境搭建与基本操作

    一、环境配置1.windows下的安装与初始化2.用户设置与服务启动 二、操作使用1.cmd操作2.python操作 一、环境配置 Postgr...

  • RDKit|分子修改与编辑

    文章目录 一、初级篇 氢原子显示与隐藏 芳香键与kekule式转换 二、高级篇 Atom和Bond对象的编辑功能 RWMol类的编辑功能 一、初...

  • Resize,w 360,h 240
    RDKit|分子基础操作与药效团查找

    分子基础操作与药效团查找 文章目录 1.原子操作 2.键操作 3.环操作 4.手动实现氧族药效团查找 1.原子操作 在rdkit中,分子中的每一...

  • RDKit|通过Recap和BRICS对分子拆解与合成

    文章目录 1.Recap拆解 2.BRICS拆解 3.BRICS合成 Recap和BRICS对分子拆解与合成 1.Recap拆解 另一个与化学反...

  • RDKit|在化学反应中对原子进行保护

    文章目录 1.rxn文件创建反应 2.保护目标原子 在化学反应中保护原子 本文是化学反应的进阶操作,关于使用rdkit进行化学反应的操作可以参考...

  • RDKit|化学反应操作与处理

    化学反应1.SMARTS创建反应2.rxn文件创建反应3.产物后处理 化学反应 Rdkit中提供了基于SMARTS的化学反应操作,可以通过SMA...

  • RDKit|骨架分解与侧链分离

    一、骨架分解1.Murcko Scaffold2.Generic Framework 二、侧链分离1.rdRGroupDecomposition...

个人介绍
聚焦科研,关注智能,设计未来