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    HMMER3.1使用

    最近在探索全基因组基因家族的分析方法,而找到某一家族需要通过保守结构域来预测,从而找到物种的某一基因家族,从而进行之后的分析。这里就需要用到HM...

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    转录组入门(8):差异基因结果注释

    作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集,对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分...

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    基于全基因组的基因家族分析(2):SlNRAMP家族基因成员鉴定

    1.找到你所感兴趣的基因家族 番茄(Solanum lycopersicum),最喜爱的蔬菜水果之一。摘录维基百科最基本的介绍,详细了解番茄的起...

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    CRISPR-Cas9系统简介

    简介 Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)——规律...

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    基于全基因组的基因家族分析(4):R包ggtree构建SlNramp家族进化树

    继续之前还没有完成的内容。因为最近在学习Y叔的R包--ggtree,所以就顺便拿这个内容来进行展示,作为一个例子来记录。nwk树文件和R代码文件...

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    GUS染色方法

    GUS应用及原理 Gus基因存在于某些细菌体内,编码β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS),该酶是一种水解酶,能催化许多β-...

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    Jalview使用方法(1)——多序列比对

    今天我们介绍一款全平台可以使用的多序列比对工具,那就是Jalview,它的功能非常强大,但是我们今天讲解最基本的多序列比对及结果输出。 1. 导...

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    基于全基因组的基因家族分析(3):SlNRAMP家族基因CDS和Genomic DNA序列获取

    今天继续进行下一步,也是序列文件的获取,有了这些数据,我们才可以进行下一步的工作,才能够绘制一些图片。 1. CDS序列获取 SlNRAMP家族...

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    TBtools使用笔记

    TBtools 是一个集合了超多生信处理的小工具,非常方便,而且是无命令行的操作,入门门槛极低。开发者是华南农业大学陈程杰博士,TBtools文...

个人介绍
植物逆境营养博士生,
喜欢折腾编程方面的东西,
爱好摄影,偶尔喜欢装文艺。