发简信
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HMMER3.1使用最近在探索全基因组基因家族的分析方法，而找到某一家族需要通过保守结构域来预测，从而找到物种的某一基因家族，从而进行之后的分析。这里就需要用到HM...
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转录组入门（8）：差异基因结果注释作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分...
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基于全基因组的基因家族分析（2）：SlNRAMP家族基因成员鉴定1.找到你所感兴趣的基因家族 番茄（Solanum lycopersicum），最喜爱的蔬菜水果之一。摘录维基百科最基本的介绍，详细了解番茄的起...
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CRISPR-Cas9系统简介简介 Clustered regularly interspaced short palindromic repeats（CRISPR）——规律...
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基于全基因组的基因家族分析（4）：R包ggtree构建SlNramp家族进化树继续之前还没有完成的内容。因为最近在学习Y叔的R包--ggtree，所以就顺便拿这个内容来进行展示，作为一个例子来记录。nwk树文件和R代码文件...
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GUS染色方法GUS应用及原理 Gus基因存在于某些细菌体内，编码β-葡萄糖苷酸酶（β-glucuronidase，GUS），该酶是一种水解酶，能催化许多β-...
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Jalview使用方法（1）——多序列比对今天我们介绍一款全平台可以使用的多序列比对工具，那就是Jalview，它的功能非常强大，但是我们今天讲解最基本的多序列比对及结果输出。 1. 导...
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基于全基因组的基因家族分析（3）：SlNRAMP家族基因CDS和Genomic DNA序列获取今天继续进行下一步，也是序列文件的获取，有了这些数据，我们才可以进行下一步的工作，才能够绘制一些图片。 1. CDS序列获取 SlNRAMP家族...
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TBtools使用笔记TBtools 是一个集合了超多生信处理的小工具，非常方便，而且是无命令行的操作，入门门槛极低。开发者是华南农业大学陈程杰博士，TBtools文...