我们关注蛋白质的功能,而结构和功能联系紧密。一旦在氨基酸序列水平发现有趣的序列(比如一个模体(motif)或者进化上保守的片段),下一步往往就是研究这段序列的3-D结构。(...
我们关注蛋白质的功能,而结构和功能联系紧密。一旦在氨基酸序列水平发现有趣的序列(比如一个模体(motif)或者进化上保守的片段),下一步往往就是研究这段序列的3-D结构。(...
原文:Microbial metabolism of dietary components to bioactive metabolites: opportunities f...
原文献:Metabolites: messengers between the microbiota and the immune systemGenes Dev. 2016...
导读 ① 对比无菌和有菌斑马鱼幼鱼,发现菌群定植影响肠道免疫细胞组成,使巨噬细胞减少、中性粒细胞增多,该现象依赖于Toll样受体(TLR)衔接蛋白Myd88;②菌群定植引起幼...
1. Nature review:一文读懂细菌影响化疗的所有已有机制(必读) NAT REV GASTRO HEPA[IF:16.99]① 肠道菌群通过促进药效、清除和损害抗...
原文:Volatile Metabolites of Pathogens: A Systematic Review 作者: Lieuwe D. J. Bos , Peter ...
人类微生物组计划HMP https://commonfund.nih.gov/hmp 国家基因库MDB https://db.cngb.org/microbiome/ Hum...
由于没有服务器,只能自己捣鼓着用windows的cmd命令行来批量下载一些数据,但是windows下高通量测序数据(如sra)下载体验真的很差,没办法,只能硬着头皮去搞 一、...
导读 NormalizeMets是一个R语言集成包,主要用于代谢组学研究中数据的归一化。这个包可以用于去除数据中的噪音,如大样本中存在的共性问题——质谱信号偏移。那么除此之外...
1. 没有中文翻译的panel 翻译医学文件,遇到了panel这个词。去查背景资料,简直大吃一惊:panel这个词竟然直接当中文用了,如下图: 那么问题来了,panel作为一...
批量生存分析 使用 coxph 回归方法 批量生存分析 使用 logrank test 方法 参考来源:生信技能树 友情链接: 课程分享生信技能树全球公益巡讲(https:...
单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
一、数据整理 1 导入数据 利用data.table包导入数据,以LUAD为例 2 选择感兴趣的临床信息 一般常规项包括submitter_id,vital_status,t...
1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度:某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一般而言,随着测序深度的增加,基因种类以及可变剪接体的数目也会...
单细胞富集分析系列: 单细胞之富集分析-1:单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...